Duyuru

Collapse
No announcement yet.

Bezelye, Pisum sativum

Collapse
X
  • Filtrele
  • Zaman
  • Göster
Hepsini Sil
new posts

  • Bezelye, Pisum sativum

    Ps d1 Candida albicans Planktonik Hücreler ve Biyofilmler Üzerindeki Etkiler

    Sónia Gonçalves , 1, * Patricia M. Silva , 1 Mário R. Felício , 1 Luciano N. de Medeiros , 2 Eleonora Kurtenbach , 2 ve Nuno C. Santos 1, *
    Yazar bilgileri Makale notları Telif hakkı ve Lisans bilgileri Sorumluluk Reddi
    Bu makale, PMC'deki diğer makaleler tarafından alıntılanmıştır . İlişkili Veriler

    Ek Malzemeler
    Git: Soyut


    Candida albicans , fırsatçı enfeksiyonlara neden olan önemli bir insan patojenidir. Planktonik hücrelerin bir substrata yapışması, biyofilm gelişimi için ilk adımdır. Antimikrobiyal peptit (AMP) Ps d1, Pisum sativum tohumlarından izole edilen bir defensindir . Bu AMP'nin C. albicans biyofilmleri ve planktonik hücreleri üzerindeki etkilerini, aktivitesini amfoterisin B ve flukonazol ile karşılaştırarak test ettik. Üç C. albicans varyantı üzerinde çalışıldı; bunlardan biri, glukosilseramid sentazdan yoksun, Ps'ye direnç veren bir mutantd1 mantar önleyici etki. Mantar hücreleri üzerindeki morfolojik ve biyomekanik değişiklikleri değerlendirmek için atomik kuvvet mikroskobu (AFM) kullanıldı. Membran bozulması ve hücresel içeriğin sızıntısı ile yüzey değişiklikleri gözlendi. Sitometri deneyleri ve konfokal mikroskopi görüntüleme, Ps d1'in zamana ve konsantrasyona bağlı bir şekilde hücre ölümüne neden olduğunu gösterdi. Bu sonuçlar, ilgili bir mantar insan patojenine karşı Ps d1 pleiotropik etkiyi gösterir ve bunun doğal bir antimikotik ajan olarak kullanılmasını önerir.

    Anahtar Kelimeler: antimikrobiyal peptitler, atomik kuvvet mikroskobu, Candida albicans , biyofilm, konfokal mikroskopi
    Git: Tanıtım


    Candida albicans , özellikle bağışıklığı baskılanmış hastalarda önemli olan oral, genital ve sistemik mantar enfeksiyonlarına neden olan fırsatçı bir insan patojenidir (Berman ve Sudbery, 2002 ). Mevcut antifungal tedavilere rağmen, bu patojenin neden olduğu mortalite ve morbidite hala yüksektir (Behnsen ve ark., 2008 ).). İntravenöz hatlar ve biyoprostetik cihazlarla ilişkili kandidiyazis problemlidir, çünkü bu cihazlar biyofilm büyümesi için substrat görevi görebilir. Biyofilmlerin varlığı, antimikrobiyal ajanlara karşı dirençleri nedeniyle ciddi sorunlara neden olabilir. Bu direnç, biyofilm topluluklarının inşası ve/veya çözülmesi için mevcut mantar popülasyonunun yerel yoğunluğuna dayalı olarak, biyofilm oluşumunda ve virülansında önemli bir rol oynayan çekirdek algılayıcı moleküllerin mevcudiyeti ile geliştirilmiştir (Donlan, 2002 ; Kruppa). , 2009 ; Deveau ve Hogan, 2011). Serbest yüzen planktonik hücreler ile biyofilm büyümesi arasında ince bir çizgi vardır. Aslında biyofilm gelişimi, planktonik hücreler substrata yapıştığında başlar. Yapışık/yapışkan hücreler büyür ve bölünerek salgılanan ekzopolisakkaritleri (EPS'ler) içeren koruyucu bir matris oluşturur (Donlan, 2002 ; Kruppa, 2009 ; Deveau ve Hogan, 2011 ). EPS'ler, bir biyofilmin hacmine ve yapışkan makroskopik özelliklerine katkıda bulunur. Tamamen gelişmiş bir biyofilm, sıvı dolu mikrokanallar tarafından yükselen ve nüfuz eden hücre katmanları ile yüksek düzeyde yapılandırılmıştır (Donlan, 2002 ).). Bu dinamik topluluklar yüzeylere yayılabilir, çevredeki partikülleri ve diğer mikropları içerebilir ve sürekli olarak yeni planktonik hücreler yayabilir (Stephens, 2002 ). C. _ albicans , çeşitli yüzeylerde tutunma, kolonize olma ve biyofilm oluşturma yeteneğine sahiptir. Bir patojen olarak C. albicans'ın önemi , hastalığı kontrol etmek ve saptamak için yeni stratejilerin geliştirilmesi konusunda önemli bir çabaya yol açmıştır (Srinivasan ve ark., 2011 ).

    Mantarlar, antifungal ajanlar için hedef olarak hizmet edebilen benzersiz bir hücre duvarına ve hücre zarına sahiptir. Fungal hücre zarı, ana sterolü ergosterol olan ve içinde proteinlerin gömülü olduğu bir lipid çift tabakasından oluşan diğer ökaryotik hücrelere benzer (Katzung ve diğerleri, 2011 ). Glikosfingolipidler (GSL), hayvanlarda, bitkilerde ve mantarlarda biyolojik zarların temel bileşenleri olarak işlev gören bir lipid ailesidir (Leipelt ve diğerleri, 2001 ; Halter ve diğerleri, 2007 ; Daniotti ve Iglesias-Bartolome, 2011 ). Mantarlarda bulunan en yaygın GSL, Pichia pastoris, C. albicans, Cryptococcus neoformans, Aspergillus fumigatus, Sporothrix schenckii gibi çoğu mantarın hücre zarında bulunan glukosilseramiddir (GlcCer).ve Neurospora crassa (Barreto-Bergter ve diğerleri, 2004 ; Saito ve diğerleri, 2006 ). Bu glikosfingolipidin büyük miktarları mantar hücre duvarında da bulunmuştur (Nimrichter ve Rodrigues, 2011 ). Mantar büyümesi/dimorfizm sırasındaki işlevleri, virülans süreci ile ilişkilendirilmiştir (Rittershaus ve diğerleri, 2006 ), bu da GSL'nin yeni mantar önleyici ilaçların geliştirilmesinde potansiyel hedefler olduğunu düşündürür (Rittershaus ve diğerleri, 2006 ; Nimrichter ve Rodrigues, 2011 ; Gonçalves ve diğerleri, 2012 ).

    Antimikrobiyal peptitler (AMP'ler), hem hidrofobik hem de hidrofilik kalıntılara sahip olan ve amfipatik yapılarla sonuçlanan kısa diziler (genellikle 15-50 amino asit kalıntısı) ile karakterize edilen katyonik moleküllerdir. Bitki, mantar veya hayvan kaynaklı endojen AMP'ler, kendilerini patojenik mikroplardan korumak için üretilir. Bu adaptif mekanizma, onları doğuştan gelen bağışıklık sistemi için gerekli kılar. AMP'lerin terapötik aktivitesi, bakterilere, mantarlara, protozoan ve metazoan parazitlere, virüslere, cilt hastalıklarına ve tümör hücrelerine karşı ortaya çıkar (Li ve diğerleri, 2012 ; Morizane ve Gallo, 2012 ; Torrent ve diğerleri, 2012 ). Terapötik aktiviteleri ve etki biçimleri hakkında kapsamlı bilgiler başka bir yerde verilmiştir (Silva ve ark., 2014 ).). Bu doğal antibiyotiklerin ek avantajı, antibiyotiğe dirençli mikrobiyal suşların gelişimine yatkın olmamalarıdır (Korting ve diğerleri, 2012 ).

    Ps d1, bahçe bezelyesinin ( Pisum sativum ) tohumlarından izole edilen, sistein açısından zengin 46 amino asit tortulu bir defensindir (Almeida ve diğerleri, 2000 , 2002 ; Cabral ve diğerleri, 2003 ; de Medeiros ve diğerleri, 2010 ) . Esas olarak epidermal dokularda ve bezelye kabuklarının damar demetlerinde bulunur. Bu peptit, birkaç filamentli mantara ve dimorfik C'ye karşı yüksek antimikrobiyal aktivite sergiler . albicans ve N. _ crassa , ancak test edilen birkaç bakteriye karşı değil (Almeida ve diğerleri, 2000 , 2002 ; Lobo ve diğerleri, 2007 ; de Medeiros ve diğerleri,2010 ). 20 uM'de Ps d1'in, C. albicans vahşi tipinin (WT) %100 büyüme inhibisyonuna neden olduğu, buna karşılık karşılık gelen C. albicans gcs -silinmiş suşunun (Δ gcs ) %70 inhibisyonuna sahip olduğu gösterilmiştir (de Medeiros ve ark . ., 2014 ). Son zamanlarda, membran bölme çalışmaları yoluyla, Ps d1'in mantar hücrelerinde olduğu gibi ergosterol ve GlcCer içeren membranlar için yüksek afinite ve özgüllüğe sahip olduğunu gösterdik (Gonçalves ve diğerleri, 2012 ). Aksine, bu defensin, kolesterol açısından zengin membranlarla düşük etkileşime sahiptir ve Ps d1'in insan hücrelerine karşı azaltılmış toksisitesini açıklar (Gonçalves ve diğerleri, 2012 ). EksikliğiC'de Ps d1 içselleştirme . albicans mutant suşu (A gcs ), konfokal mikroskopi ile gösterilmiştir (de Medeiros ve diğerleri, 2014 ). Birlikte, bu sonuçlar GlcCer'in mantar plazma zarı ile Ps d1 etkileşimi ve bunun içselleştirilmesi için önemli olduğunu gösterdi.

    Bu çalışmada, Ps d1'in etki modu, üç farklı Candida albicans suşunun hücre morfolojisi, pürüzlülüğü ve sertliği üzerindeki etkilerinin nano ölçekte değerlendirilmesi yoluyla değerlendirildi . İncelenen varyantlar için planktonik hücreler ve biyofilmler arasındaki farklar bulundu. İşlenmemiş ve tedavi edilmiş C'nin konfokal mikroskopi ve atomik kuvvet mikroskobu (AFM) görüntüleri . albicans hücreleri, Ps d1'in planktonik hücreleri 20 μM'de öldürdüğünü gösterirken, biyofilmin toplam inhibisyonu ve kısmen yok edilmesi sadece 10 kat daha yüksek bir konsantrasyonda gözlemlendi. C . _ albicans Δ gcsmutant, hem biyofilmler hem de planktonik hücreler için peptidin yokluğunda bile hücre morfolojisinde ve pürüzlülüğünde değişiklikler gösterdi. Ps d1 varlığında planktonik hücrelerin yapışması azalmış ve biyofilmin tamamen inhibisyonu ve/veya eradikasyonu gözlenmiştir. Bu sonuçlar , GlcCer'in oldukça alakalı olduğu Ps d1-mantar membran etkileşimi için birkaç anahtar yönü göstermektedir. Ek olarak, verilerimiz defensinin hücre içinde meydana gelen antimikrobiyal etkisinin ek bir bileşeniyle birlikte pleiotropik bir etkiye sahip olduğunu gösterir.

    Git: Malzemeler ve yöntemler

    Candida albicans kültürlerinin hazırlanması


    Üç Ç . albicans suşları çalışıldı: Santa Maria Hastanesi'ndeki (Lizbon, Portekiz) bir hastadan toplanan bir klinik izolat (CI), SC5314/ATCC MYA-2876 (WT) ve SC5314 CAI4 ura3 Δ ::imm434/ura3 Δ ::imm434 ( Δ gcs ), SC5314'e benzer, lütfen Dr. Dirk Warnecke (Institut für Allgemeine Botanik, Hamburg Üniversitesi, Almanya) tarafından sağlanmıştır. Δ gcs'de , glukosilseramid sentaz geni (HSX11) bozuldu ve suşun glukosilseramid lipidi üzerinde yetersiz kalmasına neden oldu (Leipelt ve diğerleri, 2001 ).). Suş stokları -80°C'de %15 gliserol ile tutuldu. Stokta önceden çözülmüş hücreler Maya Pepton Dekstroz (YPD, Sigma Aldrich, ABD) agar plakalarına aşılandı ve 48 saat 37°C'de inkübe edildi. Bu süreden sonra, izole edilmiş bir mantar kolonisi, YPD broth içinde 180 rpm'de çalkalanarak 25°C'de gece boyunca kültürlendi. Bu süre zarfında kültür, büyümenin durağan aşamasına ulaşır. Hücreler, 1.880 g'de santrifüjleme ile toplandı4°C'de 10 dakika süreyle, süpernatan çıkarıldı ve hücreler, planktonik çalışmalar için 150 mM NaCl içeren 10 mM HEPES tamponu pH 7.4 ile ve 10 mM fosfat tamponlu tuzlu su (PBS, 2.7 mM potasyum klorür, 137) ile üç kez yıkandı. Biyofilm deneyleri için mM sodyum klorür) pH 7.4. Daha sonra hücre konsantrasyonu belirlendi ve ilk süspansiyon, her deney için gerekli konsantrasyona seyreltildi. Planktonik C. albicans'ın amfoterisin B, flukonazol ve Ps d1'e duyarlılığı


    Minimal inhibitör konsantrasyonu (MIC) belirlemek için in vitro antifungal duyarlılık testleri yapıldı. Ulusal Klinik Laboratuvar Standartları Komitesi'nin (Klinik Laboratuvar Standartları Ulusal Komitesi, 1997 ) tavsiyesine göre, mikrodilüsyon yöntemiyle, 96 kuyulu mikroplakalarda belirlenmiştir (Brito ve diğerleri, 2010 ; Eksi ve diğerleri, 2013 ).). L-glutaminli (Gibco-Life Technologies, UK) RPMI 1640 ortamı kullanıldı, %0.2 glikoz, 165 mM MOPS (3-morfolinopropansülfonik asit) (AppliChem, Almanya) ile desteklendi ve pH 7.4'e tamponlandı. Karşılaştırma amacıyla ve pozitif kontrol olarak, geleneksel antifungal ilaçlar amfoterisin B (AMPH B) ve flukonazol (FCZ) (Sigma Aldrich, ABD) de seçilen suşlara karşı test edildi. Her oyuk, büyüme ortamı (RPMI), farklı AMPH B veya FCZ konsantrasyonları (0.001 ila 100 ug/ml) ve C ile toplam 200 ul hacme hazırlandı . albicans (2 × 10 3hücreler/ml). Antifungal içermeyen kontroller de test edildi. Plakalar 48 saat 37°C'de inkübe edildi, ardından optik yoğunluk 540 nm'de ölçüldü. MIC, inkübasyondan sonra bir organizmanın %100 büyüme inhibisyonuna neden olan bir ilacın minimum konsantrasyonu olarak tanımlandı (Andrews, 2001 ). Deneyler üç kopya halinde yapıldı ve değerler, MIC belirlemesi için Gompertz denklemi kullanılarak GraphPad Prism 5 ile analiz edildi (Lambert ve Pearson, 2000 ). Ps d1 ile deneyler , 90 ug/ml (20 uM)'de gerçekleştirilmiştir (de Medeiros ve diğerleri, 2014 ). Biyofilm geliştirme ve XTT/menadion testi testi


    C'nin oluşumu ve duyarlılıkları . albicans biyofilmleri, 96 oyuklu plaka bazlı yöntemle belirlendi (Pierce ve diğerleri, 2008 ). Her suş için biyofilm oluşumu için optimal hücre konsantrasyonunu belirlemek için 100 µl C. albicans süspansiyon hücreleri RPMI 1640 içinde, 1,0 × 105 , 1.0 × 106 , 1.0 × 107 ve 1.0 × 108'de glikoz % 2 ve 165 mM MOPS ilehücreler/ml polistiren 96 oyuklu bir plaka üzerine yerleştirildi, her numune üç kopya halinde. Plakalar, biyofilm gelişimi için optimal hücre konsantrasyonunu oluşturmak amacıyla 37°C'de 12, 24, 48, 72 ve 96 saat süreyle inkübe edildi. Her adım süresinin sonunda (inkübasyon süresi), biyofilm, planktonik ve/veya yapışmayan hücreleri çıkarmak için üç kez PBS ile yıkandı. Bu noktada 100 µl XTT/menadion solüsyonu (10 ml XTT 0.5 g/l içinde 1 µl menadion 1 mM) her bir kuyucuk plakasına (biyofilmin oluştuğu yer) ilave edildi ve 2 saat 37°C'de inkübe edildi. Bu süreden sonra turuncu bir renk, biyofilm içindeki hücrelerin metabolik aktivitesini ortaya çıkarır. Süpernatanlar yeni bir plakaya aktarıldı ve optik yoğunluk 490 nm'de ölçüldü. Atomik kuvvet mikroskobu görüntüleme


    Tüm C. albicans suşları için planktonik hücre görüntülemesi aşağıdaki gibi yapıldı, 1 x 105 hücre/ml HEPES tamponu içinde 25°C'de 6 ve 24 saat çalkalanarak inkübe edildi. AMPH B, FCZ ve Ps d1 nihai konsantrasyonları MİK'e eşit ve MİK'ten 10 kat daha yüksekti. Kontrol olarak, antifungal tedavisi olmayan hücreler kullanıldı. Her test örneğinden 100 ul damla, poli-L-lizin (PLL) kaplı bir lamel üzerine uygulandı ve 2 saat 25°C'de bırakıldı. Biriktirmeden sonra, numuneler filtrelenmiş (0,2 µm) deiyonize su ile 10 kez durulanmış ve 25°C'de havada kurutulmuştur.

    Muamele edilmemiş ve muamele edilmiş hücreler, bir Zeiss Axiovert 200 ters mikroskobu (Carl Zeiss MicroImaging, Jena, Almanya) üzerine monte edilmiş bir JPK NanoWizard II atomik kuvvet mikroskobu (JPK Instruments, Berlin, Almanya) kullanılarak görüntülendi. Ölçümler, aralıklı temas modunda, oda sıcaklığında, kaplanmamış silikon ACL konsolları (Applied NanoStructures, Mountain View, CA, ABD) kullanılarak gerçekleştirildi. Bu konsollar, 145-230 kHz'lik tipik rezonans frekanslarına ve 20-90 N/m'lik yay sabitlerine sahiptir. Görüntüleme için tarama hızı 1 Hz'den daha az olarak ayarlandı ve görüntü çözünürlüğü tüm görüntüler için 512 × 512 piksel olarak ayarlandı. Yükseklik, hata sinyali ve faz kontrast görüntüleri kaydedildi ve gerektiğinde hatta takıldı. Kaydedilen görüntülerden yükseklik ve boyut bilgileri JPK Veri İşleme yazılımı v.4.2.53 ile elde edilmiştir.

    AFM yükseklik görüntülerinin pürüzlülük analizi, Gwyddion 2.31 yazılımı (Çek Metroloji Enstitüsü, Brno, Çek Cumhuriyeti) kullanılarak yapıldı. Pürüzlülük, kök ortalama kare değerinden hesaplanmıştır (RMS, yani 1 × 1 µm 2 görüntülü alan üzerinde yükseklik dağılımının standart sapması). Bu işlemenin sonuçları, varyans analizi (ANOVA) ve Bonferroni son testleri kullanılarak istatistiksel olarak analiz edildi. AFM tabanlı hücre sertliği ölçümleri


    C. albicans yıkanmış süspansiyonları, oda sıcaklığında çalkalanarak 24 saat süreyle inkübe edildi. AMPH B, FCZ ve Ps d1 nihai konsantrasyonları, MIC'den 10 kat daha yüksekti. Nihai hücre konsantrasyonu 1 x 105 idihücre/ml ve kontrol olarak hücre numuneleri herhangi bir işlem görmeden inkübe edildi. Her numuneden 100 ul bir poli-L-lisin (PLL) kaplı cam lamel üzerine yerleştirildi ve 2 saat 25°C'de bırakıldı. Biriktirmeden sonra, lamel yapışmamış hücreleri çıkarmak için numuneler HEPES tamponu ile 10 kez durulandı. Numunenin kurumasını önlemek için yapıştırılan hücrelere 100 µl HEPES tamponu eklendi. Ölçümler, 25°C'de HEPES tamponunda, 200 um uzunluğunda altın refleks kaplı silikon nitrür OMCL-TR400PSA-1 konsollar (Olympus, Japonya) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bu konsollar, 8-14 kHz'lik tipik rezonans frekanslarına ve yaklaşık 0.02 N/m'lik yay sabitlerine sahiptir.

    İlk olarak, hücrelerin şekli ve yüksekliği hakkında önceden bir genel bakışa sahip olmak için, 10 µm/s'lik bir yaklaşım ve geri çekme hızı, 3 µm'lik Z uzunluğu ve 0,4 V'luk bir bağıl ayar noktası kullanılarak kuvvet haritaları yapıldı. Haritadaki koordinatlar sonra seçildi. Daha sonra, her hücre için bir konum seçildi ve 3 μm/s yaklaşma ve geri çekme hızı, 3 μm Z uzunluğu ve 0,4 V nispi ayar noktası kullanılarak bu koordinatlar üzerinde üç kopya halinde kuvvet-mesafe ölçümleri yapıldı. koşullar, tanımlamanın hücre yüksekliğinin %5 ila %10'u arasında olmasını sağlar. Geri çekme kuvveti-mesafe eğrileri, JPK Veri İşleme yazılımı v. 4.2.53 ile işlendi. İşlemden sonra, eğrilere dört taraflı piramit Hertz modifiye denklemi uygulandı ve Young modülü elde edildi. Biyofilm inhibisyonu ve eradikasyon testleri


    Biyofilm geliştirme deneylerinde elde edilen hücre koşulları kullanılarak biyofilm inhibisyonu ve eradikasyon deneyleri belirlendi. Her suş için hücre konsantrasyonları belirlendikten sonra, AMPH B, FCZ ve Ps konsantrasyonlarıBiyofilm inhibisyonu ve eradikasyon deneyleri için kullanılan d1, MIC'den 10 ve 100 kat daha fazlasına karşılık gelir. İnhibisyon deneylerinde, mantar önleyici ilaçlar hücrelerle aynı zamanda (antifungal hücrelerle önceden karıştırılarak) yerleştirildi ve daha önce biyofilm gelişimi için belirlenen aynı adım süresi sırasında inkübe edildi. Eradikasyon deneyleri için, her suş için biyofilm oluşturulduktan sonra antifungaller eklendi ve 24 saat 37°C'de inkübe edilmeye bırakıldı. Her iki durumda da biyofilm ortamı, mikroskopi ölçümleri için PBS ile değiştirildi. AFM görüntüleme için, biyofilmler 10 kez filtrelenmiş deiyonize su (0.2 um) ile yıkandı ve oda sıcaklığında havayla kurutuldu. C'nin oluşumu, inhibisyonu ve eradikasyonu için biyofilm görüntüleri . albicans suşları, hücrelerin büyütüldüğü yüzeyde doğrudan ölçüldü. Konfokal mikroskopi ve akış sitometrisi ile biyofilmlerin ve plancktonik hücrelerin Canlı/Ölü ölçümleri


    Hem C. albicans biyofilmlerinde hem de plancktonik hücrelerde Canlı/Ölü tahlil kiti kullanıldı . LIVE/DEAD® Funga Light™ Maya Canlılık Kiti ( L34952 , LifeTechnologies, ABD) iki floresan prob, SYTO 9 ve propidium iyodürden (PI) oluşur. Canlı ve ölü hücrelerden oluşan bir popülasyonda, SYTO 9 nükleik asit, bir popülasyondaki tüm mayaları, zarları sağlam olanlar ve zarları hasarlı olanlar olarak etiketler. Buna karşılık, PI yalnızca membranları hasarlı mayaya nüfuz eder ve her iki boya da mevcut olduğunda floresan rezonans enerji transferi (FRET) ile SYTO 9 leke floresansında bir azalmaya neden olur (Johnson ve Spence, 2010 ).). Sonuç olarak, zarları sağlam olan maya yeşil floresan ile boyanırken, zarları hasarlı maya kırmızı floresan ile boyanır.

    Bir Zeiss LSM 510 META konfokal nokta tarama mikroskobu (Jena, Almanya) ile optik mikroskopi deneyleri, antifungal ajanlara maruz kalmadan önce ve sonra hücrelerin yapısını ve canlılığını incelemek için yapıldı. Argon (488 nm; 45 mW) ve diyot pompalı katı hal (561 nm; 15 mW) lazerler, 40 x kuru hedef ile kullanıldı. Hücreler, görüntülemeden önce 24 saat AMPH B (10 mg/ml), FCZ (40 mg/ml) veya Ps d1 (900 ug/ml) ile inkübe edildi. Bu mantar önleyici konsantrasyonlar, planktonik MIC'den 10 kat daha fazla olacak şekilde seçilmiştir. Daha sonra biyofilmler SYTO 9 ve PI probları ile etiketlendi, 15 dakika inkübe edildi ve görüntüler alındı. Görüntüler ImageJ 1.47v (rsbweb.nih.gov/ij/) ile analiz edildi.

    Akış sitometrisi deneyleri için, C. albicans suşları , planktonik MIC'ye eşit ve 10 kat daha yüksek antifungal konsantrasyonla AMPH B, FCZ ve Ps d1 ile 24 saat süreyle inkübe edildi. Yeşil boya tüm hücrelerde mevcut olduğundan ve FRET fenomeninin yanı sıra yeşil floresan yoğunluğunun her zaman küçük bir katkısı olduğundan, çift etiketli hücreler ölüm için pozitif sonuç olarak kabul edildi. C. albicans boyamaları üreticinin talimatlarına göre yapıldı. Kısaca 1 × 10 5HEPES tamponundaki hücreler/ml, her iki boya ile 3.34 ve 20 uM'lik bir nihai konsantrasyona kadar boyandı (sırasıyla SYTO 9 ve PI). Akış sitometrisi analizinden önce tüm numuneler oda sıcaklığında karanlıkta 15 dakika tutuldu. Deneyler, lekeli hücreleri uyarmak için mavi (488 nm) ve kırmızı (640 nm) lazerler kullanılarak bir BD Accuri C6 Akış Sitometresinde (BD Biosciences, San Jose, CA, ABD) yapıldı. Yeşil floresan emisyonu 530 nm bant geçiren filtre ile ve kırmızı floresan emisyonu 670 nm bant geçiren filtre ile tespit edildi. Floresan emisyonu biyo-üssel ölçekte elde edildi ve 40 000 hücre için veriler toplandı. Tüm akış sitometresi sonuçları, FlowJo Yazılımı sürüm 10.0x (Tree Star Inc., Ashland, OR, ABD) kullanılarak analiz edildi.

    Git: Sonuçlar

    Planktonik C. albicans'ın AMPH B, FCZ ve Ps d1'e duyarlılığı


    AMPH B ve FCZ'nin üç C. albicans suşuna karşı aktivitesi, Şekil S1'de (Ek Malzeme) gösterildiği gibi antifungal ilaçlara duyarlılıkları ölçülerek belirlendi . Elde edilen eğriler uyduruldu ve MIC değerleri Gompertz denklemi kullanılarak elde edildi (Lambert ve Pearson, 2000 ). Ps d1 için kullanılan değerler önceki çalışmalarda (20 μM) rapor edilmiştir (de Medeiros ve diğerleri, 2014 ). Şekil Sl'de gösterildiği gibi , AMPH B ve FCZ için MIC değerleri, çalışılan suşa bağlı olarak farklılık göstermiştir. Toplamda, üç C. albicans suşu, AMPH B, FCZ ve Ps d1'e duyarlıydı . AMPH B ve FCZ, WT ve Δ'de benzer MIC gösterdigcs planktonik hücreler (bu dört MIC'in tümü 3,7-4,0 μg/ml aralığındadır). CI test edildiğinde daha düşük değerler elde edildi. Biyofilm geliştirme ve XTT/menadion testi testi


    Biyofilm oluşumu, hücrenin büyüme yüzeyine yapışmasına bağlıdır. Ps d1'in C üzerindeki etki modunu incelemek . albicans biyofilm oluşumu, polistiren yüzeyler seçilmiştir. Biyofilm oluşumu için koşulları optimize etmek için, üç C için XTT tahlilleri yapıldı . albicans suşları çalışıldı. En iyi biyofilm büyümesini sağlayan zaman ve hücre konsantrasyonları, Şekil S2'de (Ek Malzeme) gösterilmiştir. Görüldüğü gibi biyofilm gelişimi için ihtiyaç duyulan hücre yoğunluğu suştan suşa farklılık göstermektedir. WT ve Δ gcs , CI'den 10 kat daha yüksek bir hücre konsantrasyonuna ihtiyaç duyar (10 5hücreler/ml) biyofilm gelişimini başlatmak için. Buna rağmen, klinik izolat ve WT 24 saat sonra biyofilm oluştururken, mutant suşun biyofilm gelişimini ve yapışmasını sağlamak için 72 saate ihtiyacı vardır. AMPH B, FCZ ve Ps d1, C. albicans plancktonik hücrelerinde morfolojik değişikliklere neden olur


    Aralıklı temas modunda AFM görüntüleme, MIC'de ve 10 kat daha yüksek konsantrasyonlarda AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile 6 saat ve 24 saat inkübasyondan sonra C. albicans planktonik hücrelerinin maruz kaldığı etkileri değerlendirmek için kullanıldı . Hata sinyali, dedektör sinyali ile ayar noktası arasındaki farktır ve daha fazla uzaysal ayrıntıya sahip görüntüler sağlar. Genel olarak, antimikrobiyal tedaviler tüm hücrelerde morfolojik değişikliklere neden oldu. Bu etkilerin şiddeti zamana bağlı olarak arttı. 6 saat sonra, hücre yüzeyinde (kabarcıklar) küçük düzensizlikler ve hücrelerin üzerinde ve çevresinde biriken küçük veziküllerin MIC antifungal konsantrasyonundan 10 kat daha yüksek olduğunu gözlemlemek mümkün olmuştur (veriler gösterilmemiştir). Şekilde görüldüğü gibi​Şekil 11CI ve WT suşları için, işlenmemiş hücreler (kontroller) pürüzsüz bir yüzeye ve düzenli şekle sahiptir (Şekiller).1A,D). CI ve WT'nin aksine, işlenmemiş Δ gcs hücreleri düzensiz yüzey gösterdi (Şekil​(Şekil1G).1G). MIC konsantrasyonunda Ps d1 ile 24 saat süreyle inkübasyon , hücre yüzeyinde bazı deformasyonlar gösterdi (Şekiller).1B,E,H). 10 × MIC'de, MIC'de elde edilenlerden daha gelişmiş etkiler gözlendi (Şekiller1C,F,I). Küçük kabarcıklar eşlik eden hücrelerden salınmakta ve iç içerik serbest bırakılmaktadır (Şekil​(Şekil 11ve Şekil S7 ).
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı fcimb-07-00249-g0001.jpg
    Şekil 1
    Ps d1 konsantrasyonunun C. albicans planktonik hücreleri üzerindeki etkisi . Ps d1 : ( A , D ,G) 0 μM (kontrol) ; (B,E,H) MIC (20 μM) ve (C,F,I) 10 kat daha yüksek konsantrasyonda. Tüm görüntüler 10 × 10 μm 2'dir .

    AMPH B ve FCZ'den farklı olarak (Şekil S5 , S6 ), Ps d1 etkileri daha şiddetli görünmektedir. Mutabakat sonucu, hücre iç içeriğinin veya tamamen kabarcıklarla kaplanmış hücrelerin serbest bırakılmasıdır. WT ile muamele edilmiş hücreler için, bir kabarcığın yüksekliği yaklaşık 14 nm'dir (Şekil S3 ). Kabarcıklar birbiri üzerinde birikerek hücrenin üzerinde toplu bir yapı oluşturur. Mutant hücreler için benzer sonuçlar elde edildi (Şekil S4 ). Yalnızca CI hücreleri için, Ps d1 10 × MIC'de soyulma benzeri bir morfoloji gözlendi (Şekil​(Şekil1C).1C). Üç tedaviden AMPH B, daha kapsamlı bir hücre deformasyonunu indükleyendir: hücreler hacim kaybeder ve zarlar daha pürüzlü görünür. Klinik izolat, hem inkübasyon hem de kullanılan ilacın konsantrasyonunda FCZ'den daha az etkilenmiş gibi görünmektedir, sadece 24 saatlik inkübasyondan sonra hücre yüzeyinde bazı düzensizlikler ortaya çıkmaktadır. C. albicans , AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile işlemden sonra yüzey pürüzlülüğünde bir artışa maruz kalıyor


    Yüzey pürüzlülüğü üç C için değerlendirildi . albicans suşları, AMPH B, FCZ ve Ps d1 ile tedaviden önce ve sonra (Şekil​(Şekil 2),2), hem 6 saat hem de 24 saat hücre tedavisinden sonra. Planktonik hücrelerle gerçekleştirilen tedavilerin herhangi birinde ortalama pürüzlülükte genel bir artış oldu. Hücre yüzeyinin 1 × 1 μm 2 görüntülerine uygulanan RMS formülü ile elde edilen bu sonuçlar, antifungal tedaviden sonra yüzey pürüzlülüğünün arttığına dair önceki nitel gözlemlerle uyumludur (Şekil​(Şekil 1).1). Kontrol koşulları ile ilgili olarak, CI ve WT hücreleri daha düşük yüzey pürüzlülük değerlerine sahiptir (Şekiller).2A,D, kontrol), 5 nm'nin altında, Δ gcs hücreleri ise 5 nm'nin üzerinde yüzey pürüzlülük değerleri sunar (Şekil​(Şekil2G,2G, kontrol). WT hücreleri en çok etkilenenlerdi (Şekiller2D–F) ve Δ gcs en az etkilenen (Şekiller )2G–I) tedavilerden herhangi biri ile. AMPH B ile yapılan tüm tedaviler, CI ve WT hücrelerinde istatistiksel olarak anlamlı bir membran pürüzlülüğü artışına neden oldu (Şekiller).2A,D). Pürüzlülükteki artışları istatistiksel olarak anlamlı olmadığı için Δ gcs hücreleri için durum her zaman böyle değildi (Şekiller).2H, ben). FCZ ile tedavi edilen üç hücreyi karşılaştırırken (Şekiller2B,E,H), CI ve Δ gcs için yüzey pürüzlülüğü üzerinde daha az etki gözlendi . Aksine, WT hücreleri bu işlemden güçlü bir şekilde etkilendi ve test edilen tüm koşullar, yüzey pürüzlülüğünde istatistiksel olarak anlamlı bir artışla sonuçlandı. Son olarak, Ps d1, AMPH B'ye benzer bir şekilde CI hücrelerinin pürüzlülüğünü arttırdı (Şekil​(Şekil2C),2C), WT hücreleri için ise Ps d1'in etkileri (Şekil​(Şekil2F)2F) büyüklük olarak FCZ'ninkilere benzerdi. Yine, AMPH B ve FCZ için gözlemlendiği gibi, Δ gcs , Ps d1'den en az etkilenen ; yine de defensin, MIC'den 10 kat daha yüksek bir peptit konsantrasyonu ile 24 saatlik inkübasyondan sonra bu hücrelerin yüzey pürüzlülüğünü güçlü bir şekilde artırabildi (Şekil​(Şekil2I2I).
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı fcimb-07-00249-g0002.jpg
    şekil 2
    AMPH B (A,D,G) , FCZ ile klinik izolat (A–C) , vahşi tip (D–F) ve Δ gcs (G–I) C. albicans suşlarının inkübasyonundan sonra hücre pürüzlülüğü (RMS) ölçümleri ( B,E,H) ve Ps d1 (C,F,I) , MIC'de ve 10 kat daha yüksek konsantrasyonda. AFM yükseklik görüntülerinden, hücre üzerinde 1 x 1 µm 2 ekinlerde ölçümler elde edildi ( N = 10). Sütunlar, her deney koşulu için toplam 30 hücrede her hücre için üç bağımsız ölçümün ortalama ± standart sapmasına karşılık gelir. İki yönlü ANOVA ve Bonferroni son testi yapıldı ( * p< 0.05; ** p < 0.01; *** p < 0,001). Hata çubukları SEM'i gösterir. C. albicans , AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile tedaviden sonra sertliğini kaybeder


    Hücrelerin sertliğindeki değişiklikler iki farklı şekilde değerlendirildi. Biri, AFM tabanlı kuvvet spektroskopisi kullanılarak zarın Young modülünün belirlenmesine dayanıyordu (üç tedavi için; Şekil​Figür 3);3); ve diğeri, hücre yüzeyinin, zardaki daha yumuşak ve daha sert alanları görselleştirmeye ve ayırt etmeye izin veren AFM faz-kontrast görüntülerinin gözlemlenmesine dayanıyordu ( yalnızca Ps dl için; Şekil S7 ).
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı fcimb-07-00249-g0003.jpg
    Figür 3
    C. albicans'ın AMPH B, FCZ ve Ps d1 (konsantrasyonlar MIC'in 10 katı) ile 24 saat inkübasyonundan sonra hücre sertliği ölçümleri (AFM kuvvet-mesafe eğrilerinden hesaplanan Young modülü ). Ölçümler, her deneysel koşul için toplam 30 hücre üzerinde her hücre için üç kopyaya karşılık gelir. İki yönlü ANOVA ve Bonferroni son testi yapıldı ( * p < 0.05; ** p < 0.01; *** p < 0.001). Hata çubukları SEM'i gösterir.

    Young modülü tayini, MIC'den 10 kat daha yüksek bir AMPH B, FCZ veya Ps d1 konsantrasyonu ile 24 saatlik inkübasyondan sonra yapıldı (Şekil​(Figür 3).3). CI hücrelerinin ortalama zar sertliği değeri 354 ± 14 kPa, WT'nin ortalama değeri 384 ± 14 kPa ve Δ gcs ortalama değeri 315 ± 21 kPa idi. Δ gcs hücrelerinin sertliği WT ile karşılaştırıldığında, %18'lik bir azalma oldu (Şekilde kırmızı yıldız​Figür 3;3; * p < 0.05). Kontrole göre sertlik azaltma yüzdeleri, her bir işlemin farklı etkilerini daha iyi anlamak için hesaplanmıştır (Şekil'in altındaki koyu kırmızı kutudaki değerler).​Figür 3).3). AMPH B'nin hücre sertliği üzerindeki etkileri, hücre başlangıç ​​sertliğinde %60'lık bir azalma ile Δ gcs hücreleri için daha şiddetliydi (Şekil​(Figür 3).3). WT hücreleri, ilk sertlikte %23'lük bir azalma ile bu işlemden daha az etkilendi. FCZ, üç suş üzerinde en az etkiye sahip tedaviydi ve sertlik üzerindeki en yüksek azalma, FCZ'nin ilk sertliğin neredeyse yarısına kadar bir azalmaya neden olduğu WT hücreleri için kaydedildi. Üç tedaviden, Ps d1, CI (%67) ve WT (%57) hücrelerinin sertliğinde en büyük azalmaya neden olurken, Δ gcs hücreleri için bu, daha düşük etkiye sahip olan tedaviydi (%34 sertlik azalması). Her durumda, Ps d1 dahil olmak üzere antifungal ilaçlarla tedavi, hücre sertliğinde istatistiksel olarak anlamlı düşüşlere yol açar (Şekil​(Figür 3;3; p < 0,001).

    Ps d1 işleminden sonra C. albicans'ın faz kontrastlı görüntülemesiyle, sertlik ve yumuşaklık gibi numune özellikleriyle ilgili bazı değişiklikleri ayırt etmek mümkün olmuştur (Magonov ve diğerleri, 1997 ; Martinez ve Garcia, 2006 ; Garcia ve diğerleri, 2007 ; Nie ve diğerleri, 2011 ). Üç suşun kontrol hücrelerinin faz kontrastlı görüntülerinin tümü homojen bir yüzey sunar. Üç suş için gözlemlenen sonuçlar kabaca aynıdır. Peptit ile muamelenin neden olduğu hücre yüzeyindeki kabarcıklar, çevreleyen hücre yüzeyinden daha yumuşaktır (Şekil S7, Ek Malzemedeki faz kontrast görüntüleri) ve kabarcık oluşmadığında bile, bu görüntüler daha yumuşak ve daha sert alanların ayırt edilmesini sağlar. Ps d1, C. albicans planktonik hücrelerinde ölümü tetikler


    Ps d1'in canlı/ölü boyama yoluyla planktonik C. albicans hücrelerini öldürüp öldürmediğini belirlemek için akış sitometrisi deneyleri yapıldı . CI, WT ve Δ gcs hücreleri, MIC'ye eşit ve 10 kat daha yüksek bir AMPH B, FCZ veya Ps d1 konsantrasyonu ile 24 saat boyunca inkübe edildi . Çeyrekler (boyasız, canlı, ölü ve çift pozitif hücreler), ilgili kontrolleri kullanılarak her suş için oluşturulmuştur (veriler gösterilmemiştir).

    Figür​Şekil 44MIC ve 10 kat daha yüksekte Ps d1 ile tedaviden sonra CI, WT ve Δ gcs planktonik hücreler için elde edilen akış sitometrisi nokta grafiklerini gösterir. Burada, Ps d1'in CI hücreleri üzerinde daha az etkisi oldu ve peptit varlığında daha az hücre öldü (Şekiller).4A–C). WT ve Δ gcs için, ölü hücre yüzdesi , MIC konsantrasyonunda Ps d1 varlığında sırasıyla %70.6 ve %23.8'e yükseldi . İlginç bir şekilde, peptit konsantrasyonu 10 kat daha yükseğe çıkarıldığında, ölü hücrelerin yüzdesi Δ gcs hücreleri için (%27.8) benzer görünüyor , ancak WT hücreleri için değil (%48.7).
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı fcimb-07-00249-g0004.jpg
    Şekil 4
    Ps d1 ile tedaviden sonra klinik izolat (A–C) , vahşi tip (D–F) ve Δ gcs (G–I) planktonik hücrelerin akış sitometrisi nokta grafikleri . MIC konsantrasyonunda (20 μM) (B,E,H) ve 10 kat daha yüksek (200 μM) (C,F,I) Ps d1 ile 24 saat inkübasyondan sonra hücreler her iki boyayla da boyandı . A,D,G , kontrol).

    Tüm bu sonuçları AMPH B ve FCZ için elde edilenlerle karşılaştırarak (Şekil S8 – S10 ), Ps d1'in WT ve Δ gcs hücrelerinde daha güçlü bir etkiye sahip olduğu sonucunu çıkarmak mümkündür (Şekiller2E,F,H,I, sırasıyla) AMPH B'ye benzer (Şekil S9 , S10 ). AMPHB ve FCZ antifungalleri, CI hücrelerinde aynı etkiye sahipti: hücrelerin yaklaşık %20'si etkileriyle öldürüldü (Şekiller).4B,Cve Şekil S8 ). Ps d1 ve AMPH B, üç suşun hepsinde aynı davranışa sahipti: CI suşunda antifungal etki ile daha az hücre ölümü indüklenirken, WT ve Δ gcs hücrelerinde artan ölüm gözlendi . Aksine FCZ, C. albicans suşlarında daha az ölü hücre (%30'dan az) gösterdi. C. albicans biyofilmlerinin AFM görüntülemesi


    AMPH B, FCZ ve Ps d1'in C üzerindeki etkisini görüntülemek için AFM kullanıldı . planktonik hücreler için MIC'den 10 kat daha yüksek bir konsantrasyonda 24 saat inkübasyondan sonra albicans biyofilmleri (Şekil​(Şekil 5).5). AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile tedavi edildiğinde CI ve WT suşları için biyofilm gelişiminin inhibisyonu gözlemlendi (veriler gösterilmemiştir). Biyofilm gelişiminin inhibisyonu, hif veya psödohifa olmadığını gösterdi. Tüm antifungal tedaviler için küçük gruplar halinde (4-8 hücre) tomurcuklanan maya hücreleri gözlendi. AMPH B varlığında CI, WT'ye kıyasla daha az etkilenmiş gibi görünmektedir. CI biyofilm görüntüleri (Şekil​(Şekil5B)5B) hem yalancı hif hem de hif yokluğunu gösterir. AMPH B'nin etkisi, WT biyofilmi üzerinde daha belirgindi (Şekil​(Şekil5F):5F): küçültülmüş boyutlu hücrelerle birlikte büyük deforme olmuş hücreler. Hem CI hem de WT için, hücreler tarafından açığa çıkarılan yüzeyin varlığı, AMPH B eylemi üzerine biyofilm biyokütlesindeki değişiklikleri kanıtlar. Bu etkiler FCZ ve Ps d1 ile daha dikkat çekiciydi . CI ve WT suşları için kaplanmamış yüzey alanı arttırıldı ve hacim kaybı gözlemlendi. 10 × MIC'deki FCZ, hücre hacmi ve boyutunda bir azalmaya neden oldu (Şekiller5C,G). Ps d1 hücre yüzeyinde önemli morfolojik değişikliklere neden olmuştur. 10 x MIC'de Ps d1 ile tedavi edilen CI için kabarcıkların ortaya çıkması ve hücre hacminin kaybı gözlendi (Şekil​(Şekil5D).5D). WT, Ps d1'den daha az etkilenmiş gibi görünüyordu . Bununla birlikte, küçük kabarcıkların ortaya çıkması fark edilebilir (Şekil​(Şekil5H).5H). Canlı ve ölü hücrelerin yüzdeleri deneysel olarak ölçülmüştür (Tablo S1 ). Gösterildiği gibi, AMPH B, FCZ ve Ps d1 ile karşılaştırıldığında biyofilm eradikasyonunda daha etkilidir .
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı fcimb-07-00249-g0005.jpg
    Şekil 5
    C. albicans suşlarının AFM hata görüntüleri eradikasyon deneyleri. AMPH B (B,F) , FCZ (C,G) ve Ps d1 (D,H) yokluğunda klinik izolat (A–D) , vahşi tip (E–H) ve Δ gcs (I) 10'da × MİK. Peptit oluşan biyofilmi yok ettiğinden, Δ gcs biyofilminin AMPH B, FCZ ve/veya Ps d1 ile antifungal tedavisine ilişkin hiçbir görüntü gösterilmemiştir. 10 × 10 μm 2 olan (D,H,I) hariç tüm görüntüler 15 × 15 μm 2 'dir . C. albicans biyofilmlerinin canlı/ölü hücre konfokal görüntülemesi -inhibisyon ve eradikasyon deneyleri


    Mantar önleyici tedavilerden önce ve sonra maya hücrelerinin canlılığını değerlendirmek için, üç biyofilm “fazında” konfokal lazer tarama mikroskopi görüntüleri elde edildi: oluşan biyofilmin oluşumu, inhibisyonu ve eradikasyonu. Şekilde gösterildiği gibi​Şekil6,6, tüm suşlar için oluşturulan biyofilm, birkaç noktada birbirine bağlı bir hif ağından ve tomurcuklanan maya hücrelerinden oluşan bir 3D mimarisi sundu. Miktar tayini üzerine, biyofilm oluşturulduktan sonra ölü hücrelerin yoğunluğunun tüm suşlar için düşük (yaklaşık %10) olduğu gösterildi (Şekiller).6A,E,I). İnhibisyon deneyleri için, antifungal tedaviden sonra hiçbir hücre büyümesi gözlenmedi. Verilerimiz, AMPH B, FCZ ve Ps d1'in, gelişim hızını azaltarak biyofilm oluşumunu engellediğini göstermektedir.
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı fcimb-07-00249-g0006.jpg
    Şekil 6
    Eradikasyon testleri. C'nin konfokal mikroskopi görüntüleri . albicans suşları klinik izolatı (A–D) , vahşi tip (E–H) ve Δ gcs (I–L) , AMPH B (B,F,J) yokluğunda (A,E,I) , FCZ (C,G,K) veya Ps d1 (D,H,L) , MIC'den 10 kat daha yüksek bir konsantrasyonda.

    Eradikasyon deneyleri için, her suş için biyofilm geliştirildiğinde, antifungal 10 x MIC konsantrasyonunda ilave edildi ve 24 saat inkübe edildi. Elde edilen sonuçlar, Δ gcs suşu tarafından oluşturulan biyofilmin tamamen yok edildiğini göstermektedir (Şekil​(Şekil6),6), CI'nin aksine (Şekiller6B–D) ve WT (Rakamlar6F–H), özellikle AMPH B ile tedavi edilen CI için biyofilm mimarisinin algılanabilir/fark edilebilir değişikliklere uğradığı ve ölü hücrelerin miktarının arttığı (Şekil​(Şekil6B)6B) ve FCZ (Şekil​(Şekil6C),6C) ve AMPH B ile tedavi edilen WT için (Şekil​(Şekil6F6F).

    Git: Tartışma


    Bazı Candida türleri . suşları en yaygın antifungal ilaçlara karşı dirençli hale gelmektedir. Bu anlamda, enfeksiyonu in vivo yok etmek için bağışıklık sistemi boyunca hareket eden antimikrobiyal ajanlar oluşturmak için birçok çaba sarf edilmiştir . Ps d1, C'ye karşı antifungal etkileri olan bir AMP'dir . albicans . Bu peptidin etki modunu anlamak için , biri GlcCer sentaz geninde bir mutasyon ve bunun yanı sıra vahşi tipteki karşılığı olan üç C. albicans suşu üzerinde çalışılmıştır. Özetle, Ps d1 hücre yüzeyinde önemli morfolojik değişikliklere ve hücre ölümüne neden olmuştur. C. albicans'ın aderans testleriabiyotik yüzeye mutant, GlcCer'de eksik suş çalışması yoluyla GlcCer'in Ps d1 antifungal aktivitedeki önemini arttırdı (Lobo ve diğerleri, 2007 ). Aslında, bu çalışmada rapor edilen bazı gözlemler, Ps d1 etkilerinin C. albicans membranındaki bu lipidin varlığına bağlı olduğuna dair bu kanıtlarla uyumludur (Tyagi ve Malik, 2010a ; de Medeiros ve diğerleri, 2014 ; Rollin -Pinheiro ve diğerleri, 2016 ).

    AMP'ler, morfoloji, boyut, yükseklik, pürüzlülük ve sertlik gibi hücrelerin fiziksel özelliklerini etkileme yetenekleri açısından test edilmiştir (Canetta ve diğerleri, 2006 ; Tyagi ve Malik, 2010a , b ; Kim ve diğerleri, 2011 ; Eaton ve diğerleri, 2012 ; Alsteens ve diğerleri, 2013a , b ; El-Kirat-Chatel ve diğerleri, 2013 ; Formosa ve diğerleri, 2013 ). Önemli olarak, C. albicans hücre duvarı bileşimi, yapışma proteinlerinin ekspresyonu düzeyinde de dahil olmak üzere mantar önleyici muamele üzerine değiştirilebilir, bu nedenle hücre-hücre etkileşimlerini de etkiler (El-Kirat-Chatel ve diğerleri, 2013 ; Formosa ve diğerleri. ,2013 ). Peptidik olmayan iki geleneksel antifungal ajan (AMPH B ve FCZ) ve bir doğal AMP ( Ps d1), C'de morfolojik değişikliklere neden olur . albicans (Alviano ve diğerleri, 1999 ). Ergosterol, mantar hücre zarının önemli bir bileşenidir. Doğrudan bağlanması (AMPH B) (Gray ve diğerleri, 2012 ) veya sentezinin inhibisyonu (FCZ) (Chang ve diğerleri, 2008 , 2014 ), hücresel içeriğin sızmasına neden olarak artan hücresel geçirgenlikle sonuçlanır. C. albicans için gözlemlenen değişikliklersuşları düşük antifungal konsantrasyonda ve kısa bir inkübasyon süresinde meydana geldi: hücre hacminde azalma, hücre yüzeyinde kabarcık veya soyma etkisi, pürüzlülüğün artması (Tyagi ve Malik, 2010a , b ) ve daha düşük bir yetenek hücrelerin birbirine yapışmasını sağlar (Alsteens ve diğerleri, 2013a , b ). Bunlar, AMPH B, FCZ ve Ps d1'in eylemiyle gösterilen ortak özelliklerdi . Ps d1 için gözlemlendiği gibi (Şekil​(Şekil 4),4), soyulma benzeri bir yüzey deseni, C. albicans üzerinde sıklıkla indüklenen bir etki gibi görünüyordu . Burada sunulan sonuçlar, AMPH B, flusitozin (Kim ve diğerleri, 2011 ) ve kaspofungin (El-Kirat-Chatel ve diğerleri, 2013 ; Formosa ve diğerleri, 2013 ) tarafından C. albicans hücrelerinde indüklenen bildirilen etkilerle uyumludur. ; Haşim ve diğerleri, 2016 ).

    AMP'lerin etki modunu tanımlayan en yaygın olarak kabul edilen modeller arasında (Silva ve diğerleri, 2014 ), halı modeli, membran homojenliğinde daha büyük bir azalmaya neden olan etkileri daha iyi açıklayabilecek olanıdır ve bir deterjan- miselleşme gibi, zar direncinde bir kayıp (Chang ve diğerleri, 2008 ). Zayıflamış bir zar, bazı hücrelerde gözlenen hacim kaybını açıklayarak hücresel içeriğin sızmasına neden olarak bozulmaya maruz kalabilir (Şekil​(Şekil 4).4). Hata sinyali görüntülerini gözlemleyerek, Ps d1 ile tedavi edilen hücrelerin kontrol hücreleri gibi veya hatta AMPH B veya FCZ ile tedavi edilen hücreler gibi kümelenmediğini fark etmek de mümkün oldu . Bu, Ps d1'in hücre-hücre yapışması üzerinde bir etkisi olduğunu kanıtlayabilir. Bu sonuç, hücre duvarında Ps d1 (El-Kirat-Chatel ve diğ., 2013 ; Haşim ve diğ., 2016 ) tarafından sağlanan destabilizasyon ve zar seviyesinde olası bir deterjan benzeri etki (Da Silva) ile açıklanabilir. ve Machado, 2012 ).

    C. _ albicans planktonik hücreleri, AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile işlemden sonra yüzey pürüzlülüğünde önemli bir artış gösterdi . AFM yükseklik görüntülerinin yüzey analizi üzerine (Tyagi ve Malik, 2010a , b ; Domingues ve diğerleri, 2013 ; Franquelim ve diğerleri, 2013 ), hata sinyali görüntülerinde fark edilen membran pürüzlülüğündeki artışı ölçmek mümkün olmuştur. . Δ gcs hücrelerinin bu maddelerden daha az etkilenmesi, zaten daha pürüzlü olmalarına bağlı olabilir (Şekil 1).​(Şekil2G)2G) CI ve WT suşlarından daha, AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile tedaviden önce bile.

    Dış ajanların etkisinden kaynaklanan morfolojik değişiklikler, hücre sertliği üzerindeki değişikliklerle de ilişkilendirilebilir (El-Kirat-Chatel ve diğerleri, 2013 ; Haşim ve diğerleri, 2016 ). AFM bazlı kuvvet spektroskopisi ölçümleri, Young modül hesaplaması yoluyla hücre elastikiyetinin nicelleştirilmesine izin verdi (Domingues ve diğerleri, 2013 ; El-Kirat-Chatel ve diğerleri, 2013 ; Franquelim ve diğerleri, 2013 ). C. albicans , AMPH B, FCZ veya Ps d1 ile tedaviden sonra sertliğini kaybeder. Δ gcs hücreleri, WT muadili ile karşılaştırıldığında ortalama hücre sertliğinde %18'lik bir azalma sundu (Şekil​(Figür 3).3). Bunun nedeni GlcCer'in olmaması olabilir (Thevissen ve diğerleri, 2004 , 2012 ; Nimrichter ve Rodrigues, 2011 ). Seramidlerin membran sertliğini, stabilitesini ve biyolojik membranların yapısal organizasyonunu arttırdığı bilinmektedir (Sullan ve diğerleri, 2009 ). Hücre yüzeyi sertliği azalmasında AMPH B veya FCZ etkileriyle karşılaştırıldığında, Ps d1, kontrol örneğine göre sırasıyla %67 ve %57'lik düşüşlerle hem CI hem de WT hücreleri üzerinde daha güçlü bir etkiye sahipti (Şekil​(Figür 3).3). Ps d1'in Δ gcs hücre yüzeyinin sertliği üzerinde önemli ölçüde daha düşük bir azalmaya neden olması (%34), bu defensinin , daha önce önerildiği gibi (de Medeiros ve diğerleri, 2010 , 2014 ; Gonçalves ve diğerleri, 2012 ; Rollin-Pinheiro ve diğerleri, 2016 ). Δ gcs hücrelerinin sertliğinde AMPH B tarafından yönlendirilen güçlü azalma (%60, Şekil​Figür 3)3), bu mantar önleyici ilacın hücre yüzeyinde oluşturduğu gözenekler ile hücre zarındaki GlcCer eksikliği arasındaki sinerjistik bir etkiden kaynaklanabilir. AMPH B'nin ergosterole bağlanması geri döndürülemez olduğundan (Filippin ve diğerleri, 2008 ), C. albicans hücrelerinde GlcCer yokluğu ile birlikte, hücrenin, hücre yüzeyinde antifungal etkinin neden olduğu hasarı onarmasının bir yolu yoktur. kararsız ve daha düşük dirençli (Leipelt ve diğerleri, 2001 ).

    Ps d1 ile muameleden sonra C. albicans'ın AFM faz kontrast görüntülerine bakıldığında (Şekil S7 ), yüzeyinde, hata sinyali görüntülerinde görülen kabarcıkların lokalizasyonu ile örtüşen daha yumuşak alanları gözlemlemek mümkün olmuştur. Bu daha yumuşak alanlar muhtemelen peptidin hücre yüzeyi üzerinde birikmesinden kaynaklanan bir etkidir, sonuçta deterjan benzeri bir şekilde hareket ederek lipidlerin düzensizleşmesine ve miselleşmesine ve sonuç olarak da kararsız hücre zarı ve duvarına yol açar.

    Bir antimikrobiyal peptitin hücre ölümünü indükleme kabiliyeti, hedef(ler)ine karşı, genellikle hücre duvarı ve/veya membran seviyesinde hareket ettiği mekanizma ile ilişkilidir. Peptidin bulduğu zar tipinin önemi önemlidir; bu nedenle, suşlar arasındaki farklılıklar beklenebilir. CI hücreleri için, burada test edilen moleküllerin hiçbiri (AMPH B, FCZ ve Ps d1) önemli bir canlılık kaybına neden olmadı (Şekiller).4B,Cve Şekil S3 ), bu sadece peptidin bu hücrelerdeki etki modu ile açıklanabilir. Zarda bile, hasta hücrelerinde GlcCer moleküllerinde veya zardaki oryantasyonda bazı küçük biyokimyasal değişiklikler olabilir, bu da peptidin etki mekanizmasını etkiler (Rollin-Pinheiro ve diğerleri, 2016 ). Bununla birlikte, peptidin bu tip hücrelerde etki ederek hücrelerin pürüzlülüğünü ve sertliğini azalttığı diğer sonuçlardan açıktı (Şekiller).​(Şekiller2,2,​,3,3, sırasıyla), bu AMP'nin ölümü indüklemesi veya hücre zarını geçirgenleştirmesi zorunlu değildir, bu da ölü hücreler için neden hiçbir pozitif sonuç olmadığını açıklar.

    Ps d1 , kullanılan konsantrasyondan bağımsız olarak, geleneksel mantar önleyici moleküllerden (AMPH B ve FCZ) WT C. albicans üzerinde daha güçlü bir etkiye sahipti . Ek olarak, ölü hücrelerin yüzdesinin WT için Δ gcs hücrelerinden daha yüksek olması dikkat çekiciydi (Şekiller) .4D,F,H,I) (de Medeiros ve diğerleri, 2014 ). Δ gcs hücrelerinin zarında GlcCer'in olmaması, mantar virülansında önemli bir rol oynadığı için bu lipide ilişkin önceki gözlemleri açıklayabilir (Thevissen ve diğerleri, 2003 , 2012 ; Barreto-Bergter ve diğerleri, 2004 ). Her bir suş için hangi mekanizmanın baskın olduğu açık olmasa da, bireysel defensinlerin etki şekline ilişkin bildirilen açıklamalar hücre duvarına bağlanma, sinyal kaskadlarının indüklenmesi ve hücre içi hedeflerle etkileşim, apoptoza yol açma, membran geçirgenliği ve reseptör- aracılı içselleştirme (Thevissen ve diğerleri, 2004 ; de Medeiros ve diğerleri, 2010 ; Van Der Weerden ve diğerleri,2013 ). P sd1'in N. crassa hücre döngüsü proteini siklin F ile etkileşime girdiği ve hücre döngüsünü durdurduğu göz önüne alındığında (Lobo ve diğerleri, 2007 ), son zamanlarda, hücrelere giren ve hücre içi bir hedefle etkileşime giren C. albicans için de aynısı rapor edilmiştir . hücre ölümüne yol açar (de Medeiros ve diğerleri, 2014 ).

    Ps d1'in ilk önce mantar duvar seviyesinde etki ederek polisakkarit matrisini ayrıştırdığına ve mannoproteinler, β-glukanlar ve kitinden oluşan duvarı bozduğuna inanıyoruz. Bu, hücre pürüzlülüğünü artırarak ve sertliğini azaltarak hücre duvarının bütünlüğünü etkiler. Peptit hücre zarına ulaştığında, C'deki glukosilseramidlerle etkileşime girer . albicans membranı oluşturur ve hücre içi etkiyi indükler. Daha sonra, Ps d1'in hücre içi birikimi , daha önce C. albicans için tarif edildiği gibi (de Medeiros ve diğerleri, 2014 ), N. crassa (Lobo ) için bulunana benzer şekilde hücre döngüsü kontrol proteini siklin F'ye müdahale eder. ve diğerleri,2007 ), bu da mantar patojeninin apoptozuna yol açar.

    Planktonik hücrelerin abiyotik bir yüzeye ve diğer hücrelere yapışma yeteneği önemli bir virülans faktörüdür ve özellikle biyofilm oluşumu için önemlidir. Bu yeteneği engelleyerek, C. albicans biyofilmlerine karşı Ps d1 testi son derece alakalı hale gelir. Biyofilmler, planktonik hücrelere kıyasla artan ilaç direnci sergiler (Şekiller).​(Şekil1,1,​,5,5, sırasıyla). Bazı mantar önleyici moleküllerin etki tarzındaki değişiklikler, planktonikten sapsız hücre durumlarına (biyofilm) kadar değişir. Bu, C üzerinde AMPH B, FCZ ve Ps d1 için geçerlidir . albicans biyofilmleri (Şekiller​(Şekil5,5,​,6).6). Yüksek oranda karbonhidrat, protein, heksozamin, fosfor ve ürik asit içeren ekzopolimerler açısından zengin maddelerle çevrili biyofilmin karmaşık yapısı, dış etkenlerin penetrasyonunu kısıtlayarak etkilerini azaltabilir (Şekiller).​(Şekil5,5,​,6)6) ve artan biyofilm yaşam süresi.

    Bu çalışma , daha önce araştırılmamış olan Pisum sativum defensin 1 antifungal aktivitesinin bazı yönlerini aydınlatmaktadır . Ps d1 , hücrelerin yapışma yeteneğini engelleyerek , C. albicans hücrelerinin enfekte olmuş dokuya yapışmasını azaltarak bir enfeksiyonun çoğalmasını önlemeye de katkıda bulunabilir . Ps d1'in, yüksek oranda hücre-substrat ve hücre-hücre yapışmasına (Alsteens ve diğerleri, 2013a , b ) ve ayrıca çekirdek algılamaya (Kruppa, 2009 ) bağlı olan biyofilm oluşumuna müdahale edebileceğini düşünmek de mümkündür . Toplamda, C. albicans'ın morfolojik formlarının (mantar pleomorfizmi) kabiliyeti Ps tarafından engellendi.d1 (Şekiller​(Şekil1,1,​,55).

    AMP'lerin yapısından ve dizisinden ilham alan yeni moleküllerin moleküler tasarımı ve sentezi, yeni ve kapsamlı bir uygulama alanı açmak için umut verici bir yaklaşım gibi görünmektedir (Ören ve diğerleri, 1997 ; Wu ve diğerleri, 2003 ; McPhee ve diğerleri, 2005 ). ), antimikrobiyal tedaviden aşı adjuvanları olarak olası kullanımlarına kadar. Bu nedenle, konak savunma peptitlerinin işlev ve etki mekanizmasının daha iyi anlaşılması, anti-enfektif ve immünomodülatör terapötiklerde büyük bir vaattir. Önceki çalışmamız, Ps d1'in mantar zarlarını taklit eden bileşimdeki zarlarla etkileşime girdiğini gösterdi (Gonçalves ve ark., 2012 ).). Ergosterol ve GlcCer içeren zarlarla güçlü etkileşimler rapor edilirken, kolesterol içeren zarlarla hiçbir etkileşim, memeli hücrelerinde (kolesterol açısından zengin zarlarla) azaltılmış toksisiteyi haklı çıkarır. Burada, Ps d1'in C üzerinde güçlü ve pleiotropik bir antifungal aktiviteye sahip olduğunu gösteriyoruz . albicans ve GlcCer'in mantar zarlarının önemli bir bileşeni olarak öneminin altı çizildi.

    Git: Yazar Katkıları


    Deneyleri tasarladı ve tasarladı: SG, Ld, EK ve NS. Deneyleri gerçekleştirdi: SG, PS, MF ve Ld. Verileri analiz etti: SG, PS, MF ve Ld. Makaleyi yazdı: SG, PS, MF, Ld, EK ve NS. Çıkar çatışması beyanı


    Yazarlar, araştırmanın potansiyel bir çıkar çatışması olarak yorumlanabilecek herhangi bir ticari veya finansal ilişkinin yokluğunda gerçekleştirildiğini beyan eder.

    Git: Teşekkür


    Bu çalışma Fundação para a Ciência ea Tecnologia – Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (FCT-MCTES, Portekiz), FP7-IRSES projesi MEMPEPACROSS (Avrupa Birliği), Marie Skłodowska-Curie Araştırma ve Yenilik Personel Değişimi (MSCA-) tarafından finanse edilmiştir. RISE) projesi INPACT (çağrı H2020-MSCA-RISE-2014, hibe sözleşmesi 644167, Avrupa Birliği) ve CNPq – Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (Brezilya). MF ayrıca FCT-MCTES Doktora bursu SPRH/BD/100517/2014'ü de kabul eder.


    Git: Ek materyal


    Bu makalenin Ek Malzemesi çevrimiçi olarak şu adreste bulunabilir: http://journal.frontiersin.org/artic...ntary-material
    Ek veri dosyası için buraya tıklayın. (1,7 milyon, pdf)
    Git: Referanslar
    • Almeida MS, Cabral KM, Kurtenbach E., Almeida FC, Valente AP (2002). Pisum sativum defensin 1'in yüksek çözünürlüklü NMR ile çözelti yapısı : bitki defensinleri, farklı etki mekanizmalarına sahip özdeş omurga . J. Mol. Biol. 315 , 749-757. 10.1006/jmbi.2001.5252 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Almeida MS, Cabral KM, Zingali RB, Kurtenbach E. (2000). Bezelye ( Pisum sativum ) tohumlarından iki yeni savunma peptidinin karakterizasyonu . Kemer Biyokimya. Biyofiz. 378 , 278–286. 10.1006/abbi.2000.1824 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Alsteens D., Beaussart A., Derclaye S., El-Kirat-Chatel S., Park HR, Lipke PN, et al. . (2013a). Als aracılı mantar yapışmasının tek hücreli kuvvet spektroskopisi . Anal. Yöntem 5 , 3657–3662. 10.1039/c3ay40473k [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Alsteens D., Van Dijck P., Lipke PN, Dufrene YF (2013b). Bir mantar patojeninde hücre-hücre yapışmasını sağlayan kuvvetlerin ölçülmesi . Langmuir 29 , 13473-13480. 10.1021/la403237f [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Alviano CS, Travassos LR, Schauer R. (1999). Mantarlardaki siyalik asitler: bir mini inceleme . glikokonj. J.16 , 545-554 . 10.1023/A:1007078106280 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Andrews JM (2001). Minimum inhibitör konsantrasyonlarının belirlenmesi . J. Antimikrobiyal. kimyager. 48 ( Ek 1 ), 5-16. 10.1093/jac/48.suppl_1.5 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Barreto-Bergter E., Pinto MR, Rodrigues ML (2004). Fungal serebrositlerin yapısı ve biyolojik fonksiyonları . Bir. Acad. sutyen Cenc. 76 , 67-84. 10.1590/S0001-37652004000100007 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Behnsen J., Hartmann A., Schmaler J., Gehrke A., Brakhage AA, Zipfel PF (2008). Fırsatçı insan patojenik mantarı Aspergillus fumigatus , konakçı kompleman sisteminden kaçar . Bulaş. bağışık. 76 , 820-827. 10.1128/IAI.01037-07 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Berman J., Sudbery PE (2002). Candida albicans : tomurcuklanan mayadan alınan dersler üzerine kurulmuş moleküler bir devrim . Nat. Rev. Genetik 3 , 918-930. 10.1038/nrg948 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Brito G., Inocêncio A., Querido S., Jorge A., Koga-Ito C. (2010). Candida türlerinin in vitro antifungal duyarlılığı . HIV pozitif hastalardan ve kontrol bireylerden elde edilen oral izolatlar . Braz. Oral. Araş. 25 , 28–33. 10.1590/S1806-83242011005000001 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Cabral KM, Almeida MS, Valente AP, Almeida FC, Kurtenbach E. (2003). Pichia pastoris'te aktif antifungal Pisum sativum defensin 1'in (Psd1) üretimi : STE13 proteazın verimsizliğinin üstesinden gelmek . Protein Ekspr. Purif. 31 , 115-122. 10.1016/S1046-5928(03)00136-0 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Canetta E., Adya AK, Walker GM (2006). Etanolün maya hücresi yüzey morfolojisi üzerindeki etkilerinin atomik kuvvet mikroskobik çalışması . FEMS Mikrobiyol. Lett. 255 , 308–315. 10.1111/j.1574-6968.2005.00089.x [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Chang FM, Ou TY, Cheng WN, Chou ML, Lee KC, Chin YP, et al. . (2014). Flukonazole kısa süreli maruz kalma, Candida albicans'ta kromozom kaybına neden olur : haploid hücreler üretmek için bir yaklaşım . Mantar Genet. Biol. 70 , 68-76. 10.1016/j.fgb.2014.06.009 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Chang WK, Wimley WC, Searson PC, Hristova K., Merzlyakov M. (2008). Antimikrobiyal peptit aktivitesinin elektrokimyasal empedans spektroskopisi ile karakterizasyonu . Biyokimya. Biyofiz. Açta 1778 , 2430–2436. 10.1016/j.bbamem.2008.06.016 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Daniotti JL, Iglesias-Bartolome R. (2011). Gangliosidlerin metabolik yolları ve hücre içi ticareti . IUBMB Yaşam 63 , 513-520. 10.1002/iub.477 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Da Silva FP, Machado MCC (2012). Antimikrobiyal peptitler: klinik uygunluk ve terapötik çıkarımlar . Peptitler 36 , 308-314. 10.1016/j.peptids.2012.05.014 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • de Medeiros LN, Angeli R., Sarzedas CG, Barreto-Bergter E., Valente AP, Kurtenbach E., et al. . (2010). Antifungal P sd1 bezelye defensinin omurga dinamiği ve NMR spektroskopisi ile membran etkileşimi ile korelasyonu . Biyokimya. Biyofiz. Açta 1798 , 105-113. 10.1016/j.bbamem.2009.07.013 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • de Medeiros LN, Domitrovic T., De Andrade PC, Faria J., Bergter EB, Weissmuller G., et al. . (2014). SPR tarafından değerlendirildiği gibi mantar membran bileşenlerine karşı P sd1 bağlanma afinitesi: glukozilseramidin mantar tanıma ve girişindeki rolü . Biyopolimerler 102 , 456-464. 10.1002/bip.22570 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Deveau A., Hogan DA (2011). Candida albicans tarafından çekirdek algılama düzenlemesi ve biyofilm oluşumunun bağlanması . Yöntemler Mol. Biol. 692 , 219–233. 10.1007/978-1-60761-971-0_16 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Domingues MM, Silva PM, Franquelim HG, Carvalho FA, Castanho MA, Santos NC (2013). Gram-negatif ve Gram-pozitif bakterilerde antimikrobiyal protein rBPI kaynaklı yüzey değişiklikleri . Nanotıp 10 , 543–551. 10.1016/j.nano.2013.11.002 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Donlan RM (2002). Biyofilmler: yüzeylerde mikrobiyal yaşam . Acil. Bulaş. Dis. 8 , 881-890. 10.3201/eid0809.020063 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Eaton P., Zzarte-Luis V., Mota MM, Santos NC, Prudencio M. (2012). Plasmodium enfeksiyonu , karaciğer hücrelerinin şeklini ve sertliğini değiştirir . Nanotıp 8 , 17-19. 10.1016/j.nano.2011.10.004 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Ekşi F., Gayyurhan ED, Balcı İ. (2013). Candida türlerinin dört antifungal ajana karşı in vitro duyarlılıkları, referans et suyu mikrodilüsyon yöntemiyle değerlendirildi . ScientificWorldJournal. 2013 :236903. 10.1155/2013/236903 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • El-Kirat-Chatel S., Beaussart A., Alsteens D., Jackson DN, Lipke PN, Dufrene YF (2013). Candida albicans'ta kaspofungin kaynaklı hücre yüzeyi yeniden yapılanmasının nano ölçekli analizi . Nano ölçekli 5 , 1105-1115. 10.1039/C2NR33215A [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Filippin FB, Souza LC, Maranhao RC (2008). Trigliserit açısından zengin nanoemülsiyon ile ilişkili amfoterisin B: stabilite çalışmaları ve in vitro antifungal aktivite . Quim. Nova 31 , 591-594. 10.1590/S0100-40422008000300024 [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Formosa C., Schiavone M., Martin-Yken H., Francois JM, Duval RE, Dague E. (2013). Caspofunginin iki maya türüne, Saccharomyces cerevisiae ve Candida albicans'a karşı nano ölçekli etkileri . Antimikrobiyal. Ajanlar Chemother. 57 , 3498–3506. 10.1128/AAC.00105-13 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Franquelim HG, Gaspar D., Veiga AS, Santos NC, Castanho MA (2013). Kombine bir atomik kuvvet ve floresan mikroskobu yaklaşımı kullanarak HIV-1 füzyon inhibitörlerinin farklı membran etkileşimlerinin kodunun çözülmesi . Biyokimya. Biyofiz. Açta 1828 , 1777-1785. 10.1016/j.bbamem.2013.03.006 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Garcia R., Magerle R., Perez R. (2007). Nazik kuvvetlerle nano ölçekli kompozisyon haritalama . Nat. Anne. 6 , 405-411. 10.1038/nmat1925 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Gonçalves S., Teixeira A., Abade J., de Medeiros LN, Kurtenbach E., Santos NC (2012). Bezelye defensin P sd1'in membran lipid seçiciliğinin değerlendirilmesi . Biyokimya. Biyofiz. Açta 1818 , 1420–1426. 10.1016/j.bbamem.2012.02.012 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Gray KC, Palacios DS, Dailey I., Endo MM, Uno BE, Wilcock BC, et al. . (2012). Amfoterisin öncelikle mayayı basitçe ergosterolü bağlayarak öldürür . Proc. Natl. Acad. bilim ABD 109 , 2234-2239. 10.1073/pnas.1117280109 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Halter D., Neumann S., Van Dijk SM, Wolthoorn J., De Maziere AM, Vieira OV, et al. . (2007). Glikosfingolipid sentezinde glukozilseramidin Golgi öncesi ve sonrası translokasyonu . J. Hücre Biol. 179 , 101–115. 10.1083/jcb.200704091 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Haşim S., Allison DP, Retterer ST, Hopke A., Wheeler RT, Doktycz MJ, et al. . (2016). β-(1,3)-Glukanın bazı Candida albicans mutantlarında maskelenmesi, hücre Duvarı Yüzey Pürüzlülüğündeki artışlar ve Hücre Duvarı Elastikiyetindeki Düşüşler ile ilişkilidir . Bulaş. bağışık. 85 :e00601–e00616. 10.1128/IAI.00601-16 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Johnson I., Spence MTZ (ed.). (2010). Molecular Probes® El Kitabı , 11. Baskı'da hücre canlılığı, profil oluşturma ve fonksiyon testleri . (Life Technologies Corporation), 651-729. [ Google Akademik ]
    • Katzung BG, Ustalar SB, Trevor AJ (2011). Temel ve Klinik Farmakoloji, 12. Ed. (McGraw-Hill Companies, Inc.). [ Google Akademik ]
    • Kim KS, Kim YS, Han I., Kim MH, Jung MH, Park HK (2011). Antifungal ajanlarla tedavi edilen Candida albicans'ta hücre ölümü sürecinin nicel ve nitel analizleri . PLoS ONE 6 :e28176. 10.1371/journal.pone.0028176 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Korting HC, Schollmann C., Stauss-Grabo M., Schafer-Korting M. (2012). Antimikrobiyal peptitler ve cilt: translasyonel tıp paradigması . Cilt Eczanesi. Fizol. 25 , 323-334. 10.1159/000341990 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Kruppa M. (2009). Çekirdek algılama ve Candida albicans . Mikozlar 52 , 1-10. 10.1111/j.1439-0507.2008.01626.x [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Lambert RJ, Pearson J. (2000). Duyarlılık testi: doğru ve tekrarlanabilir minimum inhibitör konsantrasyon (MIC) ve inhibitör olmayan konsantrasyon (NIC) değerleri . J. Uygulama Mikrobiyol. 88 , 784-790. 10.1046/j.1365-2672.2000.01017.x [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Leipelt M., Warnecke D., Zahringer U., Ott C., Muller F., Hube B., et al. . (2001). Glukosilseramid sentazlar, hayvanlarda, bitkilerde ve mantarlarda glukosfingolipidlerin biyosentezinden sorumlu bir gen ailesi . J. Biol. Kimya 276 , 33621–33629. 10.1074/jbc.M104952200 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Li Y., Xiang Q., Zhang Q., Huang Y., Su Z. (2012). Antimikrobiyal peptitlerin son çalışmasına genel bakış: kökenler, işlevler, göreceli mekanizmalar ve uygulama . Peptitler 37 , 207–215. 10.1016/j.peptides.2012.07.001 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Lobo DS, Pereira IB, Fragel-Madeira L., Medeiros LN, Cabral LM, Faria J., et al. . (2007). Antifungal Pisum sativum defensin 1 , hücre döngüsü ile ilgili olarak Neurospora crassa siklin F ile etkileşime girer . Biyokimya 46 , 987-996. 10.1021/bi061441j [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Magonov SN, Elings V., Whangbo M.-H. (1997). Dokunma modu atomik kuvvet mikroskobunda faz görüntüleme ve sertlik . Sörf. bilim 375 , L385–L391. 10.1016/S0039-6028(96)01591-9 [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Martinez NF, Garcia R. (2006). Genlik modülasyonlu atomik kuvvet mikroskobu ile faz kaymalarını ve enerji yayılımını ölçme . Nanoteknoloji 17 , S167–S172. 10.1088/0957-4484/17/7/S11 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • McPhee JB, Scott MG, Hancock RE (2005). Antimikrobiyal ve bağışıklık arttırıcı aktiviteler için konak savunma peptidlerinin tasarımı . Tarak. Kimya Yüksek Verimli Ekran. 8 , 257-272. 10.2174/1386207053764558 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Morizane S., Gallo RL (2012). Sedef hastalığının patogenezinde antimikrobiyal peptitler . J. Dermatol. 39 , 225–230. 10.1111/j.1346-8138.2011.01483.x [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Ulusal Klinik Laboratuvar Standardı Komitesi (1997). Mayanın Et Suyu Seyreltme Antifungal Duyarlılık Testi için Referans Yöntemi. Onaylı Standart M27-A. Wayne PA: Klinik Laboratuvar Standardı Ulusal Komitesi. [ Google Akademik ]
    • Nie HY, Taylor AR, Lau WM, Macfabe DF (2011). Faz görüntüleme ile sabitlenmemiş sıçan beyin bölümlerinde ortaya çıkan hücre altı özellikler . Analist 136 , 2270–2276. 10.1039/c1an15125h [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Nimrichter L., Rodrigues ML (2011). Fungal glukosilseramidler: yapısal bileşenlerden yeni antimikrobiyallerin biyolojik olarak aktif hedeflerine . Ön. Mikrobiyol. 2 :212. 10.3389/fmicb.2011.00212 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Ören Z., Hong J., Shai Y. (1997). Seçici sitolitik aktiviteye sahip yeni antibakteriyel diastereomerik peptitlerin bir repertuarı . J. Biol. Kimya 272 , 14643–14649. 10.1074/jbc.272.23.14643 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Pierce CG, Uppuluri P., Tristan AR, Wormley FL, Jr., Mowat E., Ramage G., et al. . (2008). Mantar biyofilmlerinin oluşumu ve bunun antifungal duyarlılık testine uygulanması için basit ve tekrarlanabilir 96 oyuklu plaka tabanlı bir yöntem . Nat. protokol 3 , 1494–1500. 10.1038/nprot.2008.141 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Rittershaus PC, Kechichian TB, Allegood JC, Merrill AH, Jr., Hennig M., Luberto C., et al. . (2006). Glukosilseramid sentaz, Cryptococcus neoformans'ın patojenitesinin temel bir düzenleyicisidir . J. Clin. Yatırım. 116 , 1651-1659. 10.1172/JCI27890 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Rollin-Pinheiro R., Singh A., Barreto-Bergter E., Del Poeta M. (2016). Mantar enfeksiyonlarının tedavisi için hedef olarak sfingolipidler . Gelecek Med. Kimya 8 , 1469-1484. 10.4155/fmc-2016-0053 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Saito K., Takakuwa N., Ohnishi M., Oda Y. (2006). Mayada glukozilseramid varlığı ve mayanın alkali toleransı ile ilişkisi . Uygulama Mikrobiyol. Biyoteknoloji. 71 , 515-521. 10.1007/s00253-005-0187-3 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Silva PM, Goncalves S., Santos NC (2014). Defensinler: ökaryotlardan antifungal dersler . Ön. Mikrobiyol. 5:97 . 10.3389/fmicb.2014.00097 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Srinivasan A., Uppuluri P., Lopez-Ribot J., Ramasubramanian AK (2011). Yüksek verimli bir Candida albicans biyofilm çipinin geliştirilmesi . PLoS ONE 6 :e19036. 10.1371/journal.pone.0019036 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Stephens C. (2002). Mikrobiyoloji: biyofilmlerin parçalanması . Kör. Biol. 12 , R132–R134. 10.1016/S0960-9822(02)00706-6 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Sullan RM, Li JK, Zou S. (2009). Seramid ile zenginleştirilmiş alanların nanomekanik stabilitesinin ölçülmesi . Langmuir 25 , 12874–12877. 10.1021/la903442s [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Thevissen K., Ferket KK, Francois IE, Cammue BP (2003). Mantar önleyici bitki defensinlerinin mantar zarı bileşenleri ile etkileşimleri . Peptitler 24 , 1705-1712. 10.1016/j.peptids.2003.09.014 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Thevissen K., Tavares PD, Xu DM, Blankenship J., Vandenbosch D., Idkowiak-Baldys J., et al. . (2012). Bitki defensin RsAFP2, Candida albicans'ta hücre duvarı stresini, septin yanlış yerleşimini ve seramid birikimini indükler . Mol. Mikrobiyol. 84 , 166-180. 10.1111/j.1365-2958.2012.08017.x [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Thevissen K., Warnecke DC, Francois EJA, Leipelt M., Heinz E., Ott C., et al. . (2004). Böceklerden ve bitkilerden gelen defensinler, mantar glukosilseramidleri ile etkileşime girer . J. Biol. Kimya 279 , 3900–3905. 10.1074/jbc.M311165200 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Torrent M., Pulido D., Rivas L., Andreu D. (2012). Parazitler üzerinde antimikrobiyal peptit etkisi . Kör. İlaç Hedefleri 13 , 1138-1147. 10.2174/138945012802002393 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Tyagi AK, Malik A. (2010a). Limon otu yağının sıvı ve buhar fazında Candida albicans'a karşı antimikrobiyal aktivitesinin yerinde SEM, TEM ve AFM çalışmaları . Mikron 41 , 797-805. 10.1016/j.micron.2010.05.007 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Tyagi AK, Malik A. (2010b). Candida albicans'a karşı seçilmiş uçucu yağların sıvı ve buhar fazlı antifungal aktiviteleri : mikroskobik gözlemler ve Cymbopogon citratus'un kimyasal karakterizasyonu . BMC Tamamlayıcı. Alternatif. Med. 10:65 . 10.1186/1472-6882-10-65 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Van Der Weerden NL, Bleackley MR, Anderson MA (2013). Doğal olarak oluşan mantar önleyici peptitlerin özellikleri ve etki mekanizmaları . Hücre. Mol. Hayat Bilimi. 70 , 3545–3570. 10.1007/s00018-013-1260-1 [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]
    • Wu ZB, Hoover DM, Yang D., Boulegue C., Santamaria F., Oppenheim JJ, et al. . (2003). İnsan beta-defensin 3'ün antimikrobiyal ve kemotaktik aktivitelerini incelemek için mühendislik disülfid köprüleri . Proc. Natl. Acad. bilim ABD 100 , 8880–8885. 10.1073/pnas.1533186100 [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ CrossRef ] [ Google Akademik ]

  • #2
    Bezelye, Pisum sativum ve Antikanser Aktivitesi

    Runchana Rungruangmaitreeve Wannee Jiraungkoorskul 1
    Yazar bilgileri Telif hakkı ve Lisans bilgileri Sorumluluk Reddi
    Bu makale, PMC'deki diğer makaleler tarafından alıntılanmıştır .
    Git: Soyut

    Yeşil bezelye veya bahçe bezelyesi olarak bilinen Pisum sativum (Aile: Fabaceae), içerdiği lif, protein, nişasta, eser elementler ve birçok fitokimyasal madde nedeniyle uzun zamandır diyette önemli olmuştur. Antibakteriyel, antidiyabetik, antifungal, antiinflamatuar, antihiperkolesterolemi ve antioksidan aktivitelere sahip olduğu ve ayrıca antikanser özelliği gösterdiği gösterilmiştir. Besleyici olmayan biyolojik olarak aktif bileşenleri arasında alkaloidler, flavonoidler, glikozitler, izoflavonlar, fenoller, fitosteroller, fitik asit, proteaz inhibitörleri, saponinler ve tanenler bulunur. Bu bitki apigenin, hidroksibenzoik, hidroksisinnamik, luteolin ve kuersetin bakımından zengindir ve bunların hepsinin antikarsinojenez özelliği de dahil olmak üzere iyileştirici özelliklerine katkıda bulunduğu rapor edilmiştir. Antikanser özelliği hakkında yerleşik literatüre dayanarakP. sativum ve olası etki şekline ilişkin bu derleme makalesi, P. sativum'un antikanser tedavisinin geliştirilmesi için daha fazla araştırılabileceğini göstermeye odaklanmıştır .

    Anahtar Kelimeler: Antikanser, bezelye, Pisum sativum , bitki, geleneksel tıp
    Git: baklagiller

    Bakliyat veya bakliyat, besin maddelerinin miktarı ve tedavi edici tedavilerin etkinliğine sahip olduğu için dünya çapında kullanılan geleneksel ilaçlardan biridir. Baklagiller, fasulye, tahıl ve bezelyenin yanı sıra yonca, harnup, yonca, kopaifera, çemen, çivit, mercimek, meyan kökü, acı bakla, mesquite, natto, soya fasulyesi, yer fıstığı, gül ağacı ve demirhindi Fabaceae ailesinin üyesidir.[ 1 ] Baklagillerin besin değerleri, düşük yağ, yüksek protein, diyet lifi ve tıbbi özellikler, özellikle antikanser özelliği sergileyen çeşitli mikrobesinler ve fitokimyasal maddelerdir.[ 2 ] Bezelye, farklı koşullarda yetişebilen başlıca baklagillerden biridir. bölgeleri olup, dünya gıda bakliyat üretiminde soya, yer fıstığı ve kuru fasulyeden sonra dördüncü sırada yer almaktadır.[ 3] Bezelye tohumu ve filizi, insanların beslenme alışkanlıklarını değiştirerek sağlık sorunları hakkında endişe duymaları nedeniyle giderek daha fazla tüketilmektedir.[ 4 ] Bu derleme, yeşil bezelye veya bahçe bezelyesinin ( Pisum sativum ) özellikleri hakkında güncel bilgiler sağlamak için bilimsel kanıtları araştırmaktadır. mekanizması için araştırılan antikanser bitkilerinden.

    Git: TAKSONOMİK SINIFLAMA

    P. sativum'un taksonomisi Krallık'tadır ( Plantae ); Subkingdom ( Viridiplantae ); Infrakingdom ( Streptophyta ); Superdivision ( Embryophyta ); Bölüm ( Tracheophyta ); Alt Bölüm ( Spermatophytina ); Sınıf ( Magnoliopsida ); Süper sipariş ( Rosanae ); Sipariş ( Fabales ); Aile ( Fabaceae ); Cins ( Pisum ); ve Türler ( P. sativum ).[ 5 ]

    Git: İSİM

    Pisum spp'nin kökeni . Afganistan, Hindistan, Pakistan dahil olmak üzere Güneybatı Asya'da bulunur ve daha sonra subtropik ve tropik bölgelere yayılır.[ 6 ] P. sativum'un yerel adları arasında Çin bezelyesi, yenilebilir bakla bezelyesi, tarla bezelyesi, bahçe bezelyesi, yeşil bezelye, bal bezelyesi, şekerli bezelye ve tatlı bezelye (İngilizce); ertjie (Afrikalılar); katar (Bengalce); ervilha (Brezilya); jia wan dou (Çince); doperwten (Hollandaca); petiti pois (Fransızca); erbse (Almanca); kacang ercis (Endonezya); endo (Japonca); sandaek (Kmer); kacang manisi (Malezya); ervilha (Portekizce); gorak (Rusça); aroeja (İspanyolca); spritart (İsviçre); thua lan tao (Tay); bezelye (Türkçe); ropox (Ukraynaca); ve dau hoa lan (Vietnamca).[ 7 ]

    Git: PISUM SATIVUM BİTKİ TANIMI

    P. sativum , 2-3 m uzunluğa kadar büyüyen, tırmanan içi boş bir gövdeye sahip, otsu bir yıllıktır. Yapraklar alternatiftir, pinnately bileşiktir ve 2-3 çift 1.5-8 cm uzunluğunda büyük yaprak benzeri stipüllerden oluşur. Çiçeklerin beş yeşil kaynaşmış çanak yaprağı ve farklı boyutlarda beş beyaz ila kırmızımsı-mor taç yaprağı vardır. Meyve, genellikle kaba bir iç zarı olan 2,5-10 cm uzunluğunda bir bakla halinde büyür. Pod, iki sızdırmaz valften oluşan ve iki valfi birbirine bağlayan dikiş boyunca ayrılan bir tohum kabıdır. Tohumlar yuvarlak, pürüzsüz ve yeşil renklidir [Şekil 1].[ 8 ]
    Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı: PRev-11-39-g001.jpg
    Şekil 1
    Pisum sativum meyvesi (a) dış morfoloji (b) kesik yüz ve (c) tohumlar

    Git: FİTOKİMYASAL MADDELER

    P. sativum'un aktif fitokimyasal maddeleri aşağıdaki gibidir: Asparaginaz;[ 9 ] apigenin, daidzein, genistein ve kaempferol dahil flavonoidler;[ 10 ] lektin;[ 11 , 12 , 13 ] kafeik, kateşin, kumarik asitler dahil fenolik bileşikler, gentisik asitler, ferulik, protokateşik ve vanilik asitler;[ 14 , 15 ] pisatin ve allelopatik aktif maddeler;[ 16 , 17 ] proantosiyanidin;[ 18 ] saponinler;[ 19 , 20 ] brassinosteroid dahil steroid fitohormon;[ 21 , 22] ve tanenler.[ 23 ]

    Git: GELENEKSEL KULLANIMLAR

    P. sativum çiğ olarak tüketilebildiği gibi pişmiş veya dondurulmuş olarak da tüketilebilir. Çeşitli biyoaktif bileşiklerin mevcut kullanımları veya çeşitli literatür incelemelerinden elde edilen P. sativum'un fitokimyasal özellikleri antibakteriyel,[ 24 , 25 ] anti- Helicobacter pylori ,[ 26 , 27 ] antikanser,[ 28 ] antidiyabetik,[ 29 , 30 ] antifungal, [ 31 ] anti-inflamatuar,[ 32 , 33 ] antilipidemik,[ 34 , 35 ] ve antioksidan[ 36 , 37] faaliyetler. Ayrıca, insektisidal aktivite olarak da işlev görebilir.[ 38 , 39 , 40 ]

    Git: ANTİKANSER AKTİVİTE

    P. sativum'un özleri araştırılmış ve farmakolojik olarak aktif indükleyici antikanser aktivitesi olduğu bulunmuştur. Clemente ve diğerleri [ 41 , 42 ], potansiyel bir kanser kemopreventif ajanı olan Bowman-Birk tripsin-kimotripsin inhibitörünün etkisini Birleşik Krallık'tan P. sativum tohumundan elde edilen proteaz inhibitörleri, rTl1B ve rTl2B ile karşılaştırdı . İnsan kolorektal adenokarsinom HT-29'un büyümesi üzerindeki engelleyici aktiviteleri incelediler. rTl1B, etkili 46 uM IC50 gösterdi . El-Aassar ve diğerleri [ 43 ] P. sativum'u incelediMısır'dan ekstrakte edilen lektinler, karaciğer kanseri hücre hattına antiproliferatif özellik sergiledi. Patel[ 12 ] Suudi Arabistan'dan P. sativum'un yaprak ve tomurcuklarından lektin çıkardı ve MCF-7 (meme), HepG-2 (karaciğer), HEP-2 (gırtlak) ve HCT gibi birçok kanser hücre hattına sitotoksisite üzerinde çalıştı. -116 (kolon). Yakın zamanda, Stanisavljeviç ve ark .[ 28] Hırvatistan'dan farklı renklerde bezelye tohumlarından fenolik bileşiklerin miktarını belirledi. Daha koyu tohum rengi, gallik asit, epigallocatechin, naringenin ve apigenin formundaki toplam fenolik içeriğin daha yüksek olduğunu bildirdiler. Tohum özleri, örneğin LS174 (kolon), MDA-MB-453 (meme), A594 (akciğer) ve K562 (kan) gibi kötü huylu hücre hatları üzerinde sitotoksik etkiler de gösterdi. Birkaç derleme makalesinde , nişasta, protein, lif, vitaminler, mineraller ve fitokimyasalların konsantrasyonu ve özellikleri nedeniyle P. sativum'un sağlığa yararlarından bahsedilmiştir .[ 2 , 44 ] Ayrıca, aynı Fabaceae familyasındaki bitkiler de yonca, Medicago sativa gibi antikanser aktiviteleri ;[ 45 ] keçiboynuzu,Ceratonia siliqua ;[ 46 ] mercimek, Lens culinaris ;[ 47 ] ve soya fasulyesi, Glycine max .[ 48 ]

    Git: FİTOKİMYASAL MADDELER ANTİKANSER AKTİVİTE OLARAK HAREKET EDER

    Çeşitli araştırmalar, baklagiller de dahil olmak üzere tam tahıllardan zengin bir diyetin meme kanseri,[ 49 ] kolorektal kanser,[ 50 , 51 ] ve endometriyal kanser gibi kanser riskini azaltabileceğini bulmuştur . Bakliyatlarda çeşitli fito- bileşenler rapor edilmiştir. antikanser aktiviteleri. izoflavonlar

    Baklagil filizlerinde en bol bulunan izoflavonlar genistein olarak bulundu ve bunu daidzein izledi. Sukanya ve Gayathri[ 54 ] Hindistan'dan gelen baklagil filizinin izoflavon ekstraktının meme kanseri MCF-7 üzerinde büyümeyi önleyici özelliklerini inceledi. Ayrıca, Pudenz ve arkadaşları [ 55 ] izoflavonların fitoöstrojenler olarak çalıştığını ve hem in vitro hem de in vivo çalışmalarda tümör oluşumunu inhibe edebildiğini bildirdi. Mekanizmaları DNA onarımı, apoptoz indüksiyonu, hücre proliferasyonu, göçü ve istilasıydı. lektinler

    Birkaç baklagil ağacı kabuğunda en bol lektin proteinleri vardır ve bunlar antitümör ve antikanser özellikleri olarak büyük potansiyele sahiptir.[ 56 ] Diğer baklagil lektinleri ayrıca Jack fasulyesi tohumundan elde edilen bir lektin olan konkanavalin A gibi antiproliferatif ve antikanser özelliklere sahiptir.[ 57 ] Birkaç çalışma, lektinlerin deri,[ 58 ] karaciğer, safra kanalı ve kemik hücre hatları gibi çeşitli tümör hücre hatlarına sitotoksisite veya tümör inhibisyon mekanizmalarını önermiştir .[ 59 ] saponinler

    Bazı baklagiller, soya fasulyesi, nohut, yer fıstığı ve mercimek gibi antikanser aktivite sergilediği bildirilen saponinler içerir. Birkaç çalışma, baklagil saponinlerinin melanom hücresinde , [ 60 ] kolon kanserinde[ 61,62 ] ve rahim ağzı kanserinde antikanser aktivitelerine sahip olabileceğini düşündürmektedir .[ 63 ] Kanserin metastazını baskılama mekanizması Chang ve ark .[ 60 ] tarafından belirtilmiştir . hücre yüzeyinde saponinin sialiltransferaz inhibisyon aktivitesini kullanarak. Diğer mekanizma, kanser hücrelerinin programlanmış hücre ölümüne yol açan apoptoz yolu enzimlerinin saponin regülasyonuydu.[ 62 , 64 ] fenolik bileşikler

    Fenolik bileşiklerin antioksidan görevi gördüğü ve bezelyede yüksek miktarda bulunduğu kabul edilmiştir.[ 65 ] Bitki fenolik bileşiklerinin antioksidan özelliklerinin ilişkisi ve bunların kanser veya kardiyovasküler hastalıklar gibi çeşitli oksidatif stres hastalıklarının önlenmesindeki etkileri incelenmiştir. Dai ve Mumper tarafından açıklanmıştır.[ 66 ]

    Git: ÇÖZÜM

    Baklagil, iyi ve pahalı olmayan bir bitkisel besin olarak kabul edilir. İnsan beslenmesinde ve başta kanser olmak üzere birçok hastalıktan korunmada önemli rol oynar. Pek çok araştırmacı, P. sativum'un kanseri önleme ve inhibisyon olduğu kanıtlanabilen birçok besleyici ve besleyici olmayan bileşen açısından zengin olduğunu bildirmiştir. Bu derleme makalesi, antikanser bitkilerinin seçeneklerinden biri olacak yeni şifalı bitki P. sativum'u derlemeye çalışmıştır. Mali destek ve sponsorluk

    sıfır. Çıkar çatışmaları

    Herhangi bir çıkar çatışması yoktur.

    Git: teşekkür

    Mahidol Üniversitesi Fen Fakültesi, Balık Araştırma Birimi Patobiyoloji Anabilim Dalı üyelerine destekleri için özellikle teşekkür ederiz. Yazar, bu derleme makalesindeki anlayışlı yorumları ve olumlu eleştirileri için bu derleme makalesinin anonim hakemlerine ve editörlerine teşekkür eder.

    Git: REFERANSLAR

    1. Schneider AV. Avrupa'da bakliyat pazarına ve tüketimine genel bakış. Br J Nutr. 2002; 88 (Ek 3):S243–50. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    2. Vohra K, Dureja H, Garg V. Bakliyatların içgörüsü: Gıdadan kanser tedavisine. J Pharmacogn Nat Prod. 2015; 1 :108. [ Google Akademik ]
    3. Vidal-Valverde C, Frias J, Hernandex A, Martin-Alvarez P, Sierra I, Rodriquez C, et al. Bezelye ( Pisum sativum ) tohumlarında besleyici bileşiklerin ve antinutrisyonel faktörlerin değerlendirilmesi . J Sci Gıda Tarım. 2003; 83 :298–306. [ Google Akademik ]
    4. Chon SU. Çeşitli baklagillerdeki tohum ve filizlerin toplam polifenolleri ve biyoaktivitesi. Curr Ecz. 2013; 19 :6112–24. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    5. Entegre Taksonomik Bilgi Sistemi (ITIS). Begonvil spectabilis Willd. Taksonomik Seri No.:895413. Jeolojik Araştırma, VA, ABD. 2016 [ Google Akademik ]
    6. Majeed H, Safdar W, Ali B, Mohannad A, Ahmad I, Mümtaz A. Sekansa özgü amplifikasyon polimorfizm verilerine dayalı Pisum L. cinsinin genetik değerlendirmesi . J Med Tesisleri Arş. 2012; 6 :959-67. [ Google Akademik ]
    7. Lim T. Yemeklik Tıbbi ve Tıbbi Olmayan Bitkiler. Cilt 2. Meyveler, Hollanda: Springer; 2012. [ Google Akademik ]
    8. Pavek PL. Bezelye için bitki bilgi formu ( Pisum sativum L.) USDA-Doğal Kaynakları Koruma Servisi, Pullman, Washington. 2012 [ Google Akademik ]
    9. Chagas E, Sodek L. Olgunlaşmamış bezelye tohumlarının testalarından asparaginazın saflaştırılması ve özellikleri ( Pisum sativum L.) Braz Arch Biol Technol. 2001; 44 :239-45. [ Google Akademik ]
    10. Timoracká M, Vollmannová A. Renkli bezelyelerde flavonoid içeriğinin belirlenmesi ( Pisum sativum L.). doğal koşullar altında çeşitlerin bağımlılığı ve depolama süresi ile ilgili olarak. Potravinarstvo. 2010; 4 :58-62. [ Google Akademik ]
    11. Bala M, Nag T, Mathur K, Kumar S, Vyas M, Saini A, Tomar B. Bezelyede lektin aktivitesinin belirlenmesi için in vitro kallus indüksiyonu ( Pisum sativum L.). çeşit (AP-1) Rom Biotechnol Lett. 2010; 15 :5781–7. [ Google Akademik ]
    12. Patel A. Baklagil bitkilerinden yeni bir rekombinant lektin proteininin izolasyonu, karakterizasyonu ve üretimi. Biyokimya Komp. 2014; 2 :1–9. [ Google Akademik ]
    13. Ng TB, Chan YS, Ng CC, Wong JH. Yeşil bezelyeden bir lektinin saflaştırılması ve karakterizasyonu ( Pisum sativum ) Appl Biochem Biotechnol. 2015; 177 :1374–85. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    14. Troszynska A, Ciska E. Beyaz ve renkli bezelye çeşitlerinin tohum katlarının fenolik bileşikleri ( Pisum sativum L.). ve toplam antioksidan aktiviteleri. Çek J Gıda Bilimi. 2002; 20 :15–22. [ Google Akademik ]
    15. Duenas M, Estrella I, Hernandez T. Tohum kabuğunda ve bezelye kotiledonlarında fenolik bileşiklerin bulunması ( Pisum sativum L.) Eur Food Res Technol. 2004; 219 :116-23. [ Google Akademik ]
    16. Kato-Noguchi H. Pisum sativum'da allelopatik bir maddenin izolasyonu ve tanımlanması . Fitokimya. 2003; 62 :1141–4. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    17. Hadwiger LA, Tanaka K. EDTA, bezelyelerde konakçı olmayan direncin bir fitoaleksin göstergesi olan pisatin'in yeni bir indükleyicisi. Moleküller. 2014; 20 :24–34. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    18. Ferraro K, Jin AL, Nguyen TD, Reinecke DM, Ozga JA, Ro DK. Bezelye ( Pisum sativum ) tohumlarında proantosiyanidin metabolizmasının karakterizasyonu . BMC Bitki Biol. 2014; 14 :238. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    19. Tsurumi S, Takagi T, Hashimoto T. Pisum sativum'dan bir gama-pironil-triterpenoid saponin . Fitokimya. 1992; 31 :2435–8. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    20. Reim V, Rohn S. Bezelyelerde saponinlerin karakterizasyonu ( Pisum sativum L.). HPTLC ile kütle spektrometrisi ve bir hemoliz tahlili ile birleştirildi. Gıda Arş. 2015; 76 :3–10. [ Google Akademik ]
    21. Nomura T, Ueno M, Yamada Y, Takatsuto S, Takeuchi Y, Yokota T. Bezelye tohumu büyümesi ve çimlenmesinde brassinosteroidlerin ve ilgili mRNA'ların rolleri. Bitki Fizyol. 2007; 143 :1680–8. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    22. Fedina E, Yarin A, Mukhitova F, Blufard A, Chechetkin I. Yaşlanma sırasında Pisum sativum L.'nin yapraklarında Brassinosteroid kaynaklı lipid bileşimi değişiklikleri . Steroidler. 2017; 117 :25–28. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    23. Wang X, Warkentin T, Briggs C, Oomah B, Campbell C, Woods S. Tarla bezelyesinde toplam fenolikler ve yoğunlaştırılmış tanenler ( Pisum sativum L.). ve bezelye ( Lathyrus sativus L.) Euphytica. 1998; 101 :97–102. [ Google Akademik ]
    24. Nair S, Madembil N, Nair P, Raman S, Veerabadrappa S. Bazı fitolektinlerin antibakteriyel aktivitesinin karşılaştırmalı analizi. Int Curr Eczacılık J. 2013; 2 :18–22. [ Google Akademik ]
    25. Habib H, Fazili K, Zargar M, Ganie B. Bezelye Pisum sativum L. cv'nin proteaz inhibitörü ile ilişkili antimikrobiyal aktivitesi. Arkel. Int J Pure Appl Biosci. 2016; 4 :172–9. [ Google Akademik ]
    26. Ho C, Lin Y, Labbe R, Shetty K. Filizlenmiş bezelye fenolik özleri ile Helicobacter pylori'nin engellenmesi ( Pisum sativum L.) J Food Biochem. 2006; 30 :21–34. [ Google Akademik ]
    27. Niehues M, Euler M, Georgi G, Mank M, Stahl B, Hensel A. Helicobacter pylori'ye karşı yapışma önleyici aktiviteye sahip Pisum sativum L. enzimatik protein sindiriminden elde edilen peptitler : BabA, SabA, HpaA'ya karşı yapı-aktivite ve inhibitör aktivite ve bir fibronektin bağlayıcı adezin. Mol Nutr Gıda Arş. 2010; 54 :1851–61. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    28. Stanisavljevic NS, Ilic MD, Matic IZ, Jovanovic ŽS, Cupic T, Dabic D, et al. Farklı renkteki Avrupa bezelye çeşitlerinin ( Pisum sativum L.) tohum kabuklarından fenolik bileşiklerin tanımlanması. ve antioksidan ve in vitro antikanser aktivitelerinin karakterizasyonu. Nutr Kanser. 2016; 68 :988–1000. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    29. Dun XP, Li FF, Wang JH, Chen ZW. Bezelye albümini 1F'nin farelerde glikoz metabolizması üzerindeki etkisi. Peptitler. 2008; 29 :891–7. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    30. Marinangeli CP, Jones PJ. Tam ve parçalanmış sarı bezelye unları, hiperkolesterolemik ve aşırı kilolu insan deneklerde açlık insülini ve insülin direncini azaltır. Br J Nutr. 2011; 105 :110–7. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    31. Sitohy M, Dohein M, Badr H. Mısır Pisum sativum tohumlarından antifungal aktiviteye sahip bir lektinin izolasyonu ve karakterizasyonu . Gıda Kimyası 2007; 104 :971–9. [ Google Akademik ]
    32. Masini E, Bani D, Marzocca C, Mateescu M, Mannaioni P, Federico R, et al. Anafilaktik ve inflamatuar bozukluklara yeni bir terapötik yaklaşım olarak bezelye fide histaminazı. Alerjik astım ve iskemik şokta bir bitki histaminazı. Bilim Dünyası J. 2007; 7 :888–902. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    33. Utrilla MP, Peinado MJ, Ruiz R, Rodriguez-Nogales A, Algieri F, Rodriguez-Cabezas ME, et al. Bezelye ( Pisum sativum L.). tohum albümin özleri, fare kolitinin DSS modelinde anti-inflamatuar etki gösterir. Mol Nutr Gıda Arş. 2015; 59 :807–19. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    34. Alonso R, Grant G, Marzo F. Isıl işlem bezelye tohumlarının besin kalitesini iyileştirir ( Pisum sativum L.). hipokolesterolemik özelliklerini azaltmadan. Nutr Res. 2001; 21 :1067-77. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    35. Martins JM, Riottot M, de Abreu MC, Lança MJ, Viegas-Crespo AM, Almeida JA, et al. Diyet çiğ bezelye ( Pisum sativum L.), kolesterol açısından zengin diyetlerle beslenen bozulmamış ve ileorektal anastomozlu domuzlarda plazma toplam ve LDL kolesterolü ve hepatik esterlenmiş kolesterolü azaltır. J Nutr. 2004; 134 :3305–12. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    36. Amarowicz R, Karamac M, Weidner S. Bezelye fenolik fraksiyonunun antioksidan aktivitesi ( Pisum sativum ) Çek J Food Sci. 2001; 19 :139-42. [ Google Akademik ]
    37. Saha H, Prakash A, Venkat Kumar S, Manimegalai S, Devi Rajeswari V. Pisum sativum'un (bakla ve tahıl) antioksidan aktivitesinin değerlendirilmesi ve biyoaktif bileşiklerinin GCMS analizi ile tespiti. Eczane Lett. 2014; 6 :359–65. [ Google Akademik ]
    38. Taylor WG, Fields PG, Sutherland DH. Tarla bezelye özlerinden gelen böcek öldürücü bileşenler: Soyasaponinler ve lizolesitinler. J Tarım Gıda Kimya. 2004; 52 :7484-90. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    39. Sahito H, Arain M, Mal B, Channa M, Dhiloo K. Farklı insektisitlerin in vivo koşullarda bezelye Pisum sativum (L.) üzerindeki triplere karşı etkinliği. J Agric Sustain. 2013; 3 :56-77. [ Google Akademik ]
    40. Pretheep Kumar P, Balasubramanian A, Mohan S. Bezelye özlerinin etkinliği ( Pisum sativum L.). depolanmış neem ( Azadirachta indica A. Juss) tohumlarını istila eden testere dişli böceği Oryzaephilus surinamensis (L.) yönetiminde. Sky J Tarım Arş. 2015; 4 :67-71. [ Google Akademik ]
    41. Clemente A, Gee JM, Johnson IT, Mackenzie DA, Domoney C. Bezelye ( Pisum sativum L.) Bowman-Birk sınıfından proteaz inhibitörleri, in vitro insan kolorektal adenokarsinom HT29 hücrelerinin büyümesini etkiler . J Tarım Gıda Kimya. 2005; 53 :8979-86. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    42. Clemente A, Carmen Marín-Manzano M, Jiménez E, Carmen Arques M, Domoney C. Bezelyeden ( Pisum sativum L.) önemli bir Bowman-Birk izoinhibitörü olan TI1B'nin anti-proliferatif etkisi . HT29 kolon kanseri hücrelerinde proteaz inhibisyonu aracılık eder. Br J Nutr. 2012; 108 (Ek 1):S135–44. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    43. El-Aassar MR, Hafez EE, El-Deeb NM, Fouda MM. Lektin anti-kanser ajanının mikroenkapsülasyonu ve aljinat boncuklarla kontrollü salıverme, biyogüvenlik yaklaşımı. Int J Biol Macromol. 2014; 69 :88-94. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    44. Dahl WJ, Foster LM, Tyler RT. Bezelyenin sağlığa faydalarının gözden geçirilmesi ( Pisum sativum L.) Br J Nutr. 2012; 108 (Ek 1):S3–10. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    45. Rosenthal GA, Nkomo P. Alfalfa Medicago sativa (L.) Pharm Biol'de aktif bir antikanser ajanı olan L-canavanin'in doğal bolluğu . 2000; 38 :1–6. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    46. ​​Custodio L, Escapa A, Patarra J, Aligue R, Albericio F, Neng N, et al. Keçiboynuzu ağacının diri odunu ( Ceratonia siliqua L.). potansiyel bir biyoaktif bileşik kaynağı olarak. Rec Nat Prod. 2013; 7 :225–9. [ Google Akademik ]
    47. Chan YS, Yu H, Xia L, Ng TB. Yeşil benekli mercimek tohumlarından ( Lens culinaris ) elde edilen lektin, nazofaringeal karsinom hücre dizilerinde apoptozu tetikledi. Çene Med. 2015; 10:25 . [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    48. Suthar AC, Banavalikar MM, Biyani MK. Soyadan bir izoflavon olan Genistein'ın farmakolojik aktiviteleri ( Glycine max ): Kısım I – Anti-kanser aktivitesi. Hint J Exp Biol. 2001; 39 :511–9. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    49. Thompson MD, Thompson HJ, Brick MA, McGinley JN, Jiang W, Zhu Z, et al. Kuru fasulye ( Phaseolus vulgaris L.) J Nutr. 2008; 138 :2091–7. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    50. Wang Y, Wang Z, Fu L, Chen Y, Fang J. Baklagil tüketimi ve kolorektal adenom riski: Gözlemsel çalışmaların meta-analizi. PLoS Bir. 2013; 8 :e67335. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    51. Zhu B, Sun Y, Qi L, Zhong R, Miao X. Diyette baklagil tüketimi kolorektal kanser riskini azaltır: Kohort çalışmalarının meta-analizinden elde edilen kanıtlar. Bilim Temsilcisi 2015; 5 :8797. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    52. Terry P, Vainio H, Wolk A, Weiderpass E. Endometriyal kanser ile ilgili diyet faktörleri: İsveç'te ülke çapında bir vaka kontrol çalışması. Nutr Kanser. 2002; 42 :25–32. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    53. Ollberding NJ, Lim U, Wilkens LR, Setiawan VW, Shvetsov YB, Henderson BE, et al. Çok ırklı kohort çalışmasında postmenopozal kadınlarda baklagil, soya, tofu ve izoflavon alımı ve endometriyal kanser riski. J Natl Kanser Enst. 2012; 104 :67-76. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    54. Sukanya S, Gayathri G. Baklagil filizlerinde daidzein ve genistein dağılımındaki değişkenlik ve mcf-7 meme kanseri hücreleri ile antikanser aktiviteleri. Acad J Kanser Arş. 2014; 7 :173–8. [ Google Akademik ]
    55. Pudenz M, Roth K, Gerhauser C. Soya izoflavonlarının kanser önlemede epigenom üzerindeki etkisi. besinler 2014; 6 :4218–72. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    56. Liu B, Bian HJ, Bao JK. Bitki lektinleri: Tezgahtan kliniğe potansiyel antineoplastik ilaçlar. Kanser Let. 2010; 287 :1–12. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    57. Lei HY, Chang CP. Bir anti-hepatoma terapötik maddesi olarak konkanavalin A'nın lektini. J Biomed Sci. 2009; 16:10 . [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    58. Sames K, Schumacher U, Halata Z, Van Damme EJ, Peumans WJ, Asmus B, et al. Merkel hücreli karsinomların lektin ve proteoglikan histokimyası. Exp Dermatol. 2001; 10 :100–9. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    59. Wang H, Ng TB, Ooi VE, Liu WK. Farklı karbonhidrat bağlama özelliklerine sahip lektinlerin hepatom, koryokarsinom, melanom ve osteosarkom hücre hatları üzerindeki etkileri. Int J Biochem Cell Biol. 2000; 32 :365–72. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    60. Chang WW, Yu CY, Lin TW, Wang PH, Tsai YC. Soyasaponin I, hücre yüzeyinde alfa2,3-bağlı sialik asit ekspresyonunu azaltır ve B16F10 melanom hücrelerinin metastatik potansiyelini bastırır. Biochem Biophys Res Komün. 2006; 341 :614–9. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    61. Gurfinkel DM, Rao AV. Soyasaponinler: Kimyasal yapı ile kolon antikanserojenik aktivite arasındaki ilişki. Nutr Kanser. 2003; 47 :24–33. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    62. Ellington AA, Berhow MA, Singletary KW. Akt sinyalinin inhibisyonu ve arttırılmış ERK1 / 2 aktivitesi, kolon kanseri hücrelerinde triterpenoid B-grubu soyasaponinler tarafından makrootofajinin indüklenmesinde rol oynar. Karsinojenez. 2006; 27 :298–306. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    63. Xiao JX, Huang GQ, Zhu CP, Ren DD, Zhang SH. Soyasaponinler tarafından indüklenen apoptoz Hela hücreleri üzerinde morfolojik çalışma. Toksikol İn vitro . 2007; 21 :820–6. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    64. Zhu J, Xiong L, Yu B, Wu J. Saponin ailesinin yeni bir üyesi tarafından indüklenen apoptoza, Bcl-2'nin kaspaz-8'e bağlı bölünmesi aracılığıyla aracılık edilir. Mol İlaç. 2005; 68 :1831–8. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    65. Khang D, Dung T, Elzaawely A, Xuan T. Çimlendirilmiş baklagillerin fenolik profilleri ve antioksidan aktivitesi. yiyecekler. 2016; 5:27 . [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
    66. Dai J, Mumper RJ. Bitki fenolikleri: Ekstraksiyon, analiz ve bunların antioksidan ve antikanser özellikleri. Moleküller. 2010; 15 :7313–52. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]

    Yorum yap


    • #3
      Antifungal İndol ve Pirolidin-2,4-Dion Türevi Peptidomimetik Kurşun Tasarımı , Biyoaktif Peptid Ailelerinin İn Silico Çalışmasına Dayalı

      Shoeib Moradi , 1 Parisa Azerang , 1 Vahid Khalaj , 2 ve Soroush Sardari 1, *
      Yazar bilgileri Makale notları Telif hakkı ve Lisans bilgileri Sorumluluk Reddi
      Bu makale, PMC'deki diğer makaleler tarafından alıntılanmıştır .
      Git: Soyut

      Arka fon


      Fırsatçı mantar enfeksiyonlarının artması, yeni antimikrobiyal ajanların geliştirilmesine olan ihtiyacı vurgulamaktadır. Antimikrobiyal Peptitler (AMP'ler) ve Antifungal Peptitler (AFP'ler), kendilerine karşı minimum direnç geliştiren ajanlar arasındadır, bu nedenle yeni antimikrobiyal ajanların tasarımı için yapısal şablonlar olarak kullanılabilirler. yöntemler


      Bu çalışmada , Pisum sativum bitkisinin defensin'ine dayalı olarak C1 ila C4 adlı dört antifungal peptidomimetik yapı tasarlanmıştır . Bu yapılar için minimum inhibitör konsantrasyonları (MIC'ler), Aspergillus niger N402, Candida albicans ATCC 10231 ve Saccharomyces cerevisiae PTCC 5052'ye karşı belirlendi . Sonuçlar


      C1 ve C2, C3 ve C4'e kıyasla bu mantar türlerine karşı daha güçlü antifungal aktivite gösterdi . C2 yapısı , aralarında güçlü bir mantar önleyici aktivite gösterdi ve mantar önleyici peptidometik tasarımı üzerine gelecekteki çalışmalar için bir şablon olarak kullanılabilir . Dizi hizalamaları, MİK'si Aspergillus fumigatus Af293'e karşı 25 ( ug/ml ) gösteren mantar protoplastında belirlenen KTC-Y adlı antifungal dekapeptitin (KTCENLADTY) tanımlanmasına yol açtı . Çözüm


      Antifungal moleküllere ulaşmak için mevcut yaklaşım, AMP mimetik tanımlamasına dayalı biyoaktif ajanların tasarımında güçlü bir yaklaşım gibi görünmektedir.

      Anahtar Kelimeler: Antifungal ajanlar, Defensinler, İlaç tasarımı, Peptidomimetikler, Protoplastlar
      Git: Tanıtım


      Son 10 yılda mantar enfeksiyonlarının insidansı belirgin bir şekilde artmıştır ( 1 ). Ortaya çıkan çoklu ilaç direnci, çeşitli mekanizmalar yoluyla yeni ilaçların tespiti için araştırmaların başlatılmasına yol açmıştır. AMP'ler ve AFP'ler, doğuştan gelen bağışıklık tepkisinin evrimsel olarak korunmuş modülleridir ve tüm yaşam sınıfları boyunca kurulur ( 2 ). Bu peptitler, yeni terapötik ajanlar olarak potansiyel ortaya çıkaran etkili, geniş spektrumlu antibiyotiklerdir ( 3 ). Bu AMP'ler, birincil ökaryotlardan, normalde 60'tan az amino asit içeren, katyonik amino asit kalıntılarına ve zara bağlı bir amfifilik yapıya (a-sarmal ve/veya β-tabaka) sahip memelilere kadar çeşitli kaynaklarda dağıtılır ( 4 , 5). Bu mantar önleyici peptitlerin ilaç olarak uygulanması, zayıf oral ve doku absorpsiyonları, hızlı proteolitik bölünmeleri ve zayıf yarı ömürleri veya stabiliteleri nedeniyle kolay değildir. Proteinlerin ve küçük peptitlerin çoğu basitçe proteolize edildiğinden, hızlı bir şekilde atıldığından ve biyoyararlanımı yetersiz olduğundan, peptit kısımlarını değiştirme yollarını belirlemeye yönelik girişimlerde bulunulmuştur. Bu yapılar, daha fazla biyoyararlı birim elde etme beklentisiyle peptitleri taklit eden peptidomimetikler olarak adlandırılır ( 6 ). Yapay omurgaları proteazlara da dirençlidir. Peptidomimetikler, küçük moleküllü ilaç tasarımının geçiş yolunda kullanılan bir dizi probdur.

      Son zamanlarda, istenen özelliklere sahip yeni moleküllerin Bilgisayar Destekli Moleküler Tasarım (CAMD) kullanımında önemli ilerlemeler kaydedilmiştir. Bu yöntemler tipik olarak iki aşamaya dayanır: ilk aşama, Yapay Sinir Ağları (YSA) gibi doğrusal olmayan modelleme prosedürlerinin uygulanmasıyla Kantitatif Yapı Aktivite İlişkisi (QSAR) sürecinin gerçekleştirildiği ileri modellemedir ( 7 ). Bu stratejiye örnek olarak, grubumuzda ( 8 ) 100'den fazla mantar önleyici peptit, yapay sinir ağları ile analiz edildi ve mantar önleyici peptitlerin biyoaktivitesini etkileyen en önemli fizikokimyasal parametrelerin Log P ve bağıl amfipatisite olduğu gözlemlendi.

      Bu çalışmada, biyoinformatik ve peptidomimetik stratejisi kullanılarak antifungal peptit yapılarına dayalı olarak 4 antifungal peptidomimetik yapı tasarlanmıştır. Tasarlanan bileşikler hazırlandı ve antimikrobiyal aktivite için test edildi.

      Git: Malzemeler ve yöntemler

      Veri toplama


      Bu çalışma için 60'tan fazla mantar önleyici peptit seçildi. Amino asit dizileri, aralarında paylaşılan amino asit dizilerini bulmak için dizi hizalamaları için girdi verileri olarak kullanıldı. Sıra hizalamaları


      T-Coffee v5.13, 2007 ve ClustalW (1.82) çoklu dizi hizalaması Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü ( 53 ) mantar önleyici peptitlerin dizi hizalamaları için kullanıldı. T-Coffee çok sıralı bir hizalama paketidir ( 54). Bir dizi dizi (Proteinler veya DNA) verildiğinde, T-Kahve çoklu dizi hizalaması oluşturur. Dizi hizalamadan sonra, her gruptaki tüm mantar önleyici peptitlerde tekrarlanan belirli diziler arasında bazı korelasyonlar bulundu. Daha fazla dizi benzerliğine sahip AFP'ler, CLASTALW hizalaması kullanılarak aralarındaki son deseni çıkarmak için seçildi. Peptidomimetik yapılar, puanların renklere dayalı olduğu T-kahve kullanılarak son dizi hizalamasından elde edilen son desene dayalı olarak tasarlandı; kurum içi peptit kitaplığı ile tutarlılığı olmayan konumlar mavi, biraz yeşil, daha iyi konumlar sarı, ardından turuncu ve son olarak kırmızıdır. Sarıdan kırmızıya pozisyonların tamamen doğru olması bekleniyor.

      Benzerlik araştırması, kristalografi yapılarını bulmak için dizi hizalamalarından nihai modele yakın amino asit dizilerini bulmak için yapıldı. Bizim çalışmamız durumunda, T-kahve dizi hizalamaları, koyu turuncu ila kırmızı renklere sahip olarak ortalama ve iyi arasında puanlar gösterdi. Bu amaca ulaşmak için Temel Yerel Hizalama Arama Aracı (BLAST) ( 55 ) ve RCSB Protein Veri Bankası ( 56 ) kullanıldı. mimetik tasarım


      Mimetik karşılıkları tasarlamak için SuperMimic yazılımı ( 57 , 58 ) kullanıldı. Bu araç, bir proteinin veya peptidin parçalarını değiştirebilen veya taklit edebilen potansiyel peptidik olmayan yapı taşlarını bulmak için ve bunun tersine, bir protein içinde bu tür yapı taşlarının eklenebileceği konumları belirlemek için kullanılmaktadır. Bir proteinin parçalarını taklit eden bileşikleri veya mimetikleri yerleştirmek için uygun proteinlerdeki pozisyonları tanımlar. SuperMimic, beta dönüşlü veya gama dönüşlü mimetikler gibi alt kütüphanelerde düzenlenmiş 126 peptidomimetik yapıdan oluşan bir kütüphane sağlar ( 59 ). KTC-Y'yi SuperMimic kütüphanesindeki peptidomimetik yapılarla değiştirmek için SuperMimic programı ©2006 kullanıldı. Peptit ve mimetik hazırlama


      Dekapeptit KTC-Y (KTCENLADTY) sentezlendi ve SBS biyo-şirketi, Pekin, Çin'den satın alındı. Bileşikler Cı ve C2 , Sigma Aldrich, Eteinhim , Almanya'dan satın alındı ​​ve C3 ve C4, Enamine kimyasal tedarikçisi şirketinden satın alındı. protoplast hazırlama


      Protoplastlar, bazı modifikasyonlarla Osherov ve Romano ( 57 ) tarafından açıklanan protokole göre hazırlandı . Kısaca, 20 ml Sabouraud dekstroz broth ortamı, 109 / ml taze Aspergillus niger ( A. niger ) N402 veya Aspergillus fumigatus ( A. fumigatus ) Af293 ile aşılandı ve bir çalkalayıcı inkübatörde, 32 ° C'de 6-7 saat inkübe edildi. C , 250 rpm konidianın %70'inden fazlası germ tüpü oluşana kadar. Çimlenen sporlar daha sonra hasat edildi ve bir litik enzim karışımı içinde yeniden süspanse edildi (0.6 M'de %5 Glucanex KCl, 0.05 Sitrik asit pH=5.8, %1 glukoz) ve 2 saat 30 ° C'de , 100 rpm'de inkübe edildi . Elde edilen protoplastlar, bir tezgah üstü santrifüjde 2000 rpm'de 5 dakika santrifüjleme yoluyla toplandı . Protoplastlar iki kez 20 ml 0.6 M KCl içinde yıkandı ve 1 ml RPMI 1640 ortamında yeniden süspanse edildi, bikarbonat olmadan hazırlandı, 0.165 M 3-( N -morfolino) propansülfonik asit (MOPS) ile tamponlandı ve 10 M ile pH=7.0'a ayarlandı. NaOH. Bu ortam ayrıca %2 glikoz ve 1.2 Mozmotik stabilizatör olarak sorbitol. Toz halinde antifungal peptit elde edildi ve su içinde 5 mg/ml'lik bir stok solüsyon hazırlandı. MIC seviyesi, yukarıdaki ortamda antifungal peptidin konsantrasyon aralığı (0-200 ug/ml ) boyunca iki kat seri seyreltmelerin hazırlanması yoluyla 96 oyuklu mikrotitre plakalarında belirlendi . Her kuyunun toplam hacmi, 104 mantar hücresi içeren 100 ul idi. Plaka kapatıldı ve 37 °C'de 24-48 saat inkübe edildi . MIC değerleri, büyüme olmayan kuyunun konsantrasyonu okunarak elde edildi. mantar önleyici tarama


      A. niger N402, Candida albicans ATCC 10231 ve Saccharomyces cerevisiae PTCC 5052 test suşları olarak kullanıldı. Bileşikler, 10 mg/ml'lik bir konsantrasyona ulaşmak için Dimetil Sülfoksit (DMSO) içinde çözündürüldü . Antifungal aktivite testleri için broth mikrodilüsyon yöntemi uygulandı. Mantar aşılarının , son seyreltmelerden sonra 96 ​​oyuklu mikroplakanın her oyuğunda 103 mantara eşit uygun mikroorganizma yoğunluğuna ulaşması için 530 nm'de okundu . Çalışan mantar kültürü, et suyu ile 1:1000 seyreltme ( örn ., .10 ul stok mantar kültürü: 10 ml ) stok mantar kültüründen hazırlandı.et suyu). Besiyeri olarak Sabouraud Maltose Broth (SMB) kullanıldı.

      NCCLS M27-A yöntemine dayalı modifiye antimikrobiyal duyarlılık testi yapıldı ( 60 , 61 ). 96 oyuklu bir plakanın her bir oyuğuna et suyu (100 ul ) ilave edildi ve daha sonra (A) kuyusuna 40 ul bileşik ve 60 ul et suyu eklendi, ardından (A) kuyusundan seri olarak seyreltilen bir çözelti (100 ul ) (B) içine 100 ul elde edildi. Bu iki kat seyreltme plakada devam ettirildi ve son kuyudan (H) 100 ul atıldı. Daha sonra tüm kuyucuklar 100 µl ile dolduruldu.çalışan maya kültürü. Mantar testinde itrakonazol referans olarak kullanılmıştır. Bu deney için aşağıdaki kontroller hazırlanmıştır: sadece DMSO ve itrakonazolün seri seyreltmesini içeren kuyucuklar. Plaka kapatıldı ve 37 °C'de 24-48 saat inkübe edildi . MIC değerleri, büyüme olmayan kuyunun konsantrasyonu okunarak elde edildi.

      Git: Sonuçlar

      Sıra hizalamaları


      Antifungal peptit dizileri arasında daha iyi bir homoloji bulmak için çeşitli dizi hizalamaları gerçekleştirilmiştir (tablo 1). Çalışmamızda tasarlanan ve KTC-Y'ye yol açan nihai peptit paterni, aşağıda gösterilen T-KAHVE kullanılarak, birbirine daha fazla dizi homolojisi gösteren 10 antifungal peptitten elde edildi.Şekil 1. Nihai dizi hizalama modeli, "-"nin herhangi bir amino asit olabileceği K-CENLA-DTY idi. Son dizi hizalamaları için kullanılan tüm 10 AFP'nin kaynağı ve bunlardan elde edilen nihai model, orijinal olarak bitkilerdendi. Böylece bitkiler aleminden AFP olan defensin dizisine yakın bir model elde ettik. Bu model, kendisine yakın kristalografi yapılarını bulmak için benzerlik aramasında kullanıldı. Yapıları keşfetmek için WU-BLAST2 - Protein Veritabanı Sorgusu, NCBI-BLAST2 - Protein Veritabanı Sorgusu, FASTA ve SSEARCH - Protein Benzerlik Araması ve RCSB Protein Veri Bankası kullanıldı. İlginç bir şekilde, PDB ID'sinin 1JKZ olduğu son modelimize %90.909 benzerlik gösteren bir yapı bulundu.
      Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı: AJMB-5-42-g001.jpg
      Şekil 1
      Seçilen desene yol açan AFP'ler arasında nihai diziler hizalaması tablo 1


      Antifungal peptitler, amino asit dizileri, moleküler ağırlıkları ve kaynakları
      plörostrinin 6500 VRPYLVAF istiridye mantarı ( 9 )
      vulgarinin 7000 KTCENLADTYKGPCFTSGGD Kuru fasulye ( Phaseolus vulgaris ) ( 10 )
      cicerin 8200 ARCENFADSYRQPPISSSQT nohut tohumları ( 11 )
      Arietin 5600 GVGYKVVVTTTAAAADDDDVV nohut tohumları ( 11 )
      P1 7800 RGPQAFYEERLM Bir Brassica türünün tohumları ( 12 )
      Fa-AMP1 3879 AQCGAQGGGATCPGGLCCSQWGWCGSTPKYCGAGCQSNCK Fagopyrum esculentum Moench ( 13 )
      Fa-AMP2 3906 AQCGAQGGGATCPGGLCCSQWGWCGSTPKYCGAGCQSNCR Fagopyrum esculentum Moench ( 13 )
      Lunatusin 7200 KTCENLADTFRGPCFATSNC Lima fasulyesi ( Phaseolus lunatus L.) ( 14 )
      Dolabellanin B2 3873 SHQDCYEALHKCMASHSKPFSCSMKFHMCLQQQ Deniz tavşanı Dolabella auricularia ( 15 )
      pleurotus AFP 1600 DNGEAGRAAR Mantar Pleurotus erygii ( 16 )
      Tu-AMP1 4988 KSCCRNTVARNCYNVCRIPGTPRPPVCAATCDCKLITGTKCPPGYEK Tulipa gesneriana1 ( 17 )
      Tu-AMP2 5006 KSCCRNTTARNCYNVCRIPGTPRPVCAATCDCKIITGTKCPPGYEK Tulipa gesneriana2 ( 17 )
      Ib-AMP1 2200 EWGRRCCGWGPGRRYCVRWC Impatin balzamina ( 18 )
      Berevin -2 3630 GLLDSLKFAATAGKGVLQSLLSTASCKLAKTC kurbağa derisi ( 8 )
      Ib-AMP4 2350 EWGRRCCGWGPGRRYCRRWC Impatin balzamina ( 18 )
      payet 7000 KTCENLADTY öğütülmüş fasulye ( 19 )
      EAFP1 4212 QTCASRCPRPCNAGLCCSIYGYCGSGNAYCGAGNCRCQCRG zeytin ( 20 )
      EAFP2 4169 QTCASRCPRPCNAGLCCSIYGYCGSGAAYCGAGNCRCQCRG Eucommia ulmoides Oliv ( 20 )
      cucurmoschin 8000 PQRGEGGRAGNLLREEQEI Siyah kabak çekirdeği ( 21 )
      CW-3 7150 PEDPQRRYQEEQRRE Malva parviflora tohumları ( 22 )
      CW-4 5000 DRQIDMEEQQLEKLNKQDRPGLRYAAKQQQMTRMG Malva parviflora tohumları ( 22 )
      CW-5 7300 ITCGQVTSQVAGCLSYLQRGGAPAPGIRNLMA Malva parviflora tohumları ( 22 )
      koksinin 6700 KQTENLADTY koşucu fasulye ( 23 )
      agrosibin 9000 ANDPQCLYGNVAAKF Mantar Agrocybe cylindracea ( 24 )
      AC-AMP 3520 GECVRGRCPSGMCCSQFGYCGCKCGKPKYCGR aarnthus kaudatus ( 8 )
      Pn-AMP1 43000 QQCGRQASGRLCGNRLCCSQWGYCGSTASYCGAGCQSQCRS Pharbitis nil L. tohumu ( 25 )
      Pn-AMP2 43570 QQCGRQASGRLCGNRLCCSQWGYCGSTASYCGAGCQSQCR Seed of Pharbitis nil L. (25)
      Lentil AFP 11000 TETNSFSITKFSPDGNKLIFQGDGYTTKGK Red lentil seeds (26)
      Alveolarin 2800 GVCDMADLA Mushroom Polyporus alveolaris (27)
      Lentin 2750 CQRAFNNPRDDAIRW Shitake mushroom (28)
      Lyophyllin 8950 ITFQGASPARQTVITNAITRARADVRAAVSALPTKAPVST Lyophyllum shimeji (29)
      IWF6 4070 RPRPRPCIRAGGYCNILNVCCAGLTCKKHDIQDAACV Sugar beet leaves (8)
      LAP 7600 AGTEIVTCYNAGTKVPRGPSAGGAIDFFN Fruiting bodies of L. shimeji (29)
      Psc-AFP 6700 EPILDVNGGSSYYMVPRIWA Psoralea corylifolia seeds (30)
      Red bean 5700 RTCENLANTYRGPCI Seeds of the red bean (31)
      Pinto bean 5600 KTCENLADTYKGPCFT Seeds of the pinto bean (31)
      α-Basrubrin 4300 GADFQECMKEHSQKQHQHQG Ceylon spinach seeds (32)
      PAFP-s 3929 AGCIKNGGRCNASAGPPYCCSSYCFQIAGQSYGVCKNR Seeds of Phytolacca americana (33)
      SMAP-29 3198 RGLRRLGRKIAHGVKKYGPTVLRIIRIA Sheep leukocytes (34)
      Cicadin 16500 NEYHGFVDKANNENKRKKQQGRDDFVVKPNNFANRRRKDDYNENYYDDVD AADVV Dried Juvenile cicadas (35)
      Pe-AFP2 2750 QSERFEQQMQGQDFSHDERFLSQAA Passion fruit Passiflora edulis (17)
      Eryngin 10500 ATRVVYCNRRSGSVVGGDDTVYYEG Mushroom Pleurotus eryngii (36)
      β-Basrubrin 5900 KIMAKPSKFYEQLRGR Ceylon spinach seeds (32)
      Psalmotoxin 3300 ACGILHDNCVYVPAQNPCCRGLQLQRYGKCLVQV Venom of tarantula (37)
      Pe-AFP1 5600 QSERFEQQMQGQDFSHDERFLSQAA Passiflora edulis seeds (17)
      Drosomycin 4840 DCLSGRYKGPCAVWDNETCRRVCKEEGRSSGHCSPSLKCWCEGC Drosophila (38)
      Histatin 3 3410 DSHAKRHHGYKRKFHEKHHSHRGKRSNKLYDN Saliva of humans (39)
      GAFP 4180 DPTCSVLGDFKCNPGRCCSKINYCGACYQWRFGLTPAR Leaves of Ginkgo biloba (40)
      Tenecin 4730 VTCDILSVEAKGVKLNDAACAAHCLFRGRSGGYCNGKRVCVCRr Insect defencin peptides (41)
      Triptecin 1430 VRRFPWWWPFLRR Synthetic (8)
      Esculentin-1 5170 GIFSKLGRKKIKNLLISGLKNVGKEVGMDVVRTGIDIAGCKIKGEC Skins of frogs (42)
      Melitin 2750 GIGAVLKVLTTGLPALISWIKRKRQQ Apis mellifera (43)
      MP1 1210 KKVVFKVKFKK Combinatorial chemistry (44)
      MP6 1320 CNHKVVFKVKFK Synthetic from MP (44)
      DSP 4510 AVRIGPCDQVCPRIVPERHECCRAHGRSGYAYCSGGGMYCN Leaf beetle (45)
      Gymnin 6500 KTCENLADDY Yunnan bean (46)
      Halocidin 2530 RIIDLLWRVRRPQKPKFVTVWVR Hemocytes of the tunicate (47)
      Ascalin 9500 YQCGQGG Shallot bulbs (48)
      Pisum sativum 1500 AKKKKTEEN Pisum sativum var. arvense Poir (49)
      Cicerarin 8000 VKSTGRADDDLAVKTKYLPP Green chickpea (50)
      Ar-AMP 3156 AGECVQGRCPSGMCCSQFGYCGRGPKYCGR Amaranthus retroflexus L. seeds (51)
      aktiçinin 2500 GAKRAYDEVEAQN altın kivi ( 52 )
      Ayrı bir pencerede aç
      Protein Veri Bankasında (PDB) belirtildiği gibi bu protein ve yapısı hakkında bilgi, moleküler açıklama SAVUNMA İLE İLGİLİ PEPTİT 1; sınıflandırma: mantar önleyici protein; kaynağın bilimsel adı: Pisum sativum ; aile: bitki defensinleri. Çoklu hizalamadan elde edilen nihai peptit deseni, kaynağının bitkiden olduğu ve defensins ailesine ait olduğu yapıya yol açtı. 1JKZ'ye yüksek sekans özdeşliğine sahip olmak, antifungal aktivitesi için peptidin önemli bir parçası olan peptidin N-terminal kısmından başlar.

      Bu çalışmada, 1JKZ'nin kristalize yapısının (nihai modele yüksek benzerlik gösteren 10 amino asit dizisi içeren) sadece N-terminal kısmının SuperMimic programına girilmesi gerekmiş ve bu yapının diğer kısımlarına ihtiyaç duyulmamıştır. Bu nedenle söz konusu alanın (N-terminali) yapısının diğer bölümlerinden ayrılmasına ihtiyaç duyulmuştur. İlgili segmentin 3D yapısını elde etmek için adayımızın N-terminal dizilerini kesmek için Swiss-pdb Viewer ( 62 ) kullanıldı. Bu yapı KTC-Y olarak adlandırılmış ve peptidomimetik yapıların elde edilmesi için SuperMimic programında girdi yapısı olarak kullanılmıştır. mimetik tasarım


      Yaklaşık 114 peptidomimetik yapı, SuperMimic programı kullanılarak KTC-Y'ye yerleştirilmek üzere eşleştirildi. 9×10 -3 Å Kök Ortalama Kare Sapması (RMSD)'den daha düşük ve KTC-Y omurgası ve yan zincirlerine daha fazla benzerlik gösteren peptidomimetikler seçildi. KTC-Y, yapısının N-terminali ve C-terminali arasındaki güçlü antifungal bölgesini incelemek ve belirlemek için 2 bölüme ayrılmıştır. Dört peptidomimetik yapı elde edildi; N-terminal kısmı için iki yapı ve C-terminal kısmı için iki yapı tasarlanmıştır (şekil 2). İki peptidomimetik yapı, KTC-Y'nin A1 ve A2 olarak adlandırılan N-terminal bölgesinin arka kemiği ve yan zincirlerinin, sırasıyla 0.009 ve 0.007 A'ya eşit RMSD ile değiştirilmesiyle oluşturulmuştur . Moleküller Bı ve B2, KTC-Y'nin 5 ila 10 amino asit içeren C-terminal kısmından peptidomimetik yapıları temsil eder ve elde edilen RMSD sırasıyla 0.008 ve 0.007 A'ya eşittir . Bu yapılar muhtemelen mantar zarından geçebilecek kadar küçük değildir.
      Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı AJMB-5-42-g002.jpg
      şekil 2
      SuperMimic Programı tarafından tasarlanan peptidomimetik yapılar

      Sonuç olarak, dört peptidomimetik ile yüksek benzerlik gösteren daha küçük yapıları bulmak için benzerlik araştırması yapıldı. Enhanced NCI Veritabanı Tarayıcısını ( 63 ) kullanan bu veritabanı ayrıca yapılarla ilgili verilerin özetini gösterir ve seçilen yapının daha önce çalışılıp çalışılmadığını gösterir. Bu veri tabanı ayrıca yapıların aktivitesini tahmin edebilir ve yapının mikroorganizmalara karşı aktivitesini tahmin etmeye yardımcı olabilir. Bulunan tüm yapılar arasından antifungal aktivite için daha önce çalışılmamış yapılar seçildi. çinko ( 64) sanal tarama için ticari olarak mevcut bileşiklerin bir veritabanı olarak, bu bileşiklerin satın alma için şirketler aracılığıyla kullanılabilirliğini ortaya çıkarmak için uygulandı. Son olarak, antifungal biyoaktivite taraması için elde edilen moleküller arasından dört yapı seçildi (Figür 3).
      Resim, illüstrasyon vb. içeren harici bir dosya. Nesne adı: AJMB-5-42-g003.jpg
      Figür 3
      Mantar önleyici tarama için C 1 , C 2 , C 3 ve C 4 adlı nihai bileşiklerProtoplast ve antifungal tarama


      Benzerlik araştırması yoluyla elde edilen dört bileşik (Figür 3) protoplast ve antifungal özellikleri açısından taranmıştır. Bu bileşikler, inhibisyon seviyesini belirlemek için test edildi ve sonuçlar,Tablo 2. Testin genel yeteneği, bir pozitif kontrol ajanı dahil edilerek onaylandı. Negatif kontrol olarak DMSO çözücüsü tarafından inhibisyon olmadı. Test edilen bileşikler arasında, C3 ve C4 , kabul edilebilir antifungal aktiviteler göstermedi. C1 ve C2 , A. niger ve Saccharomyces cerevisiae'ye ( S. cerevisiae ) karşı daha fazla antifungal aktiviteye sahipti . Bileşik C2 , A. niger ve S. cerevisiae'ye karşı bileşikler arasında en düşük MIC'yi temsil eder . Bileşik C 2 , A. niger'e karşı Candida albicans'tan daha etkilidir (C. albicans ) ve test edilen mantar türleri üzerinde C1 , C3 ve C4'ten daha fazla antifungal aktivite gösterir . Bu sonuçlar nedeniyle, C 2 ve C 1 , gelecekteki çalışmalar ve gelişimsel araştırmalar için bir seçenek olabilir. Tablo 2


      KTC-Y'nin A. fumigatus Af293'e karşı protoplast tahlili sonucu ve dört mimetik bileşiğin A. niger , C. albicans ve S. cerevisiae'ye karşı broth seyreltme yöntemiyle elde edilen antifungal etkisi; MIC değerleri µg/ml olarak ifade edilir
      KTC-Y - * - - - >2000 >2000 25
      C1 - 1000 - 500 - 250 *** ***
      C2 250 500 - 125 - 125 nt
      C3 - 1000 - 1000 - 1000 nt
      C4 - 1000 - >1000 - 1000 nt
      itrakonazol 0.12 2 - 1 - 8 <0.1
      Ayrı bir pencerede aç
      * “-” okunabilir büyüme olmadığı anlamına gelir
      ** Test A. fumigatus üzerinde yapılmıştır.
      *** “nt” test edilmemiş anlamına gelir
      Dekapeptit KTC-Y, antifungal biyoanalizde test edildi ve test edilen mantar türlerinin hiçbirinde 2000 ug/ml'ye kadar aktivite göstermedi ; bu, mantar önleyici etkisini saptamak için daha yüksek KTC-Y konsantrasyonlarının kullanılması gerektiği veya peptidin hücre zarından geçemeyeceği anlamına gelir. İkinci olasılığı test etmek için, KTC-Y, protoplast tahlilinde A. fumigatus'a karşı test edildiğinde, güçlü bir aktivite gösterdi, MIC=25 µg/ml (Tablo 2). Yukarıda bahsedilen test, KTC-Y peptidinin aktif olma olasılığına daha fazla destek sağlar ve A. fumigatus'un hücre duvarı, KTC-Y'nin hücre zarındaki veya hücrenin kendisindeki aktif bölgesine girmesine izin vermeyen hücre duvarı olabilir. .

      Git: Tartışma


      AIDS, kanser ve organ nakli hastaları gibi bağışıklığı baskılanmış hastalarda, çeşitli tip ve sıklıkta yaşamı tehdit eden sistemik mantar enfeksiyonlarında endişe verici bir artış görülmektedir. Vasküler kateter kullanımı, periton diyalizi, hemodiyaliz ve parenteral beslenme gibi invaziv tıbbi prosedürler de mantar enfeksiyonlarının artmasına katkıda bulunmuştur. Halihazırda kullanılan mantar önleyici maddelere dirençli mantar suşlarının ortaya çıkmasıyla sorun daha da kötüleşir. Bu nedenle, yeni ilaçların tasarımı ve halihazırda kullanılan ilaçların daha da geliştirilmesi elzemdir. Bu moleküllerin tam biyofiziksel karakterizasyonunun yanı sıra uygun hücresel hedefler için araştırmalar başlamıştır.

      Hücre ve moleküler biyoloji, mikrobiyoloji, biyokimya ve rekombinant DNA teknolojisindeki son gelişmeler moleküler hedeflerin karakterizasyonuna büyük katkı sağlamıştır. İlaç keşfine yönelik modern yaklaşım, biyokimyasal hedeflerin ( esas olarak proteinler) tanımlanmasına ve tanımlanmasına ve ardından bu hedefleri, onları etkisiz hale getirmek için gereken özelliklere sahip küçük moleküller ile eşleştirmeye odaklanır . yapı temelli ilaç tasarımı.

      Antifungal ilaç hedeflerinin üç boyutlu karakterizasyonu ve antifungal ajanların etki modunun anlaşılması, modern ilaç araştırmalarında vazgeçilmez araçlardır. Yapıya dayalı ilaç tasarımının başarısı, yinelemeli bir prosedür gerektirir ( 65 ). Ayrıntılı olarak analiz edilen proteinin yapısı, daha sonra sentezlenmesi ve test edilmesi gereken bir ligandın tasarımına izin verir. Biyolojik veriler ve yeni protein-ligand kompleksi tayini, tamamlayıcılık hakkında çalışan hipotezleri iyileştirmeye yardımcı olur. Bu adımların tekrarlanması, ilk bileşikte artan bir iyileşmeye yol açar.

      Proteinler işlevlerini kompakt, iyi düzenlenmiş yapılara katlanarak gerçekleştirirler ( 66 ). Filogenetik ağaç tahmini, ikincil yapı tahmini ve kritik kalıntı tanımlaması dahil olmak üzere birçok uygulamada protein dizilerinin çoklu hizalanması önemlidir ( 67 ). Dizi hizalama, biyoinformatik ve karşılaştırmalı genomikte yaygın bir araçtır ( 68 ). Mevcut çalışmada, ClustalW, BLAST ve T-Coffee kullanılarak tüm AFP'lerin amino asit dizileri arasında homolojiye sahip modelin çıkarılması için yapılan araştırma, 10 amino asit dizisi ile nihai modele yol açtı. Bu modele daha fazla homoloji gösteren AFP'ler bitkilere aitti. Bu desenden defensin grubuna ait kristalize yapı elde edilmiştir. Defensinler, bitkiden elde edilen başlıca AFP'lerdir ( 69).

      Bu sonuçları ve bilgileri bir araya getirerek ve dizi hizalamalarının yardımıyla, nihai kalıbın bitki kaynaklı antifungal peptitlerden geldiğini ve bu nedenle KTC-Y yapısına benzer şekilde ekstrakte edilen kristalize yapının en önemli olan defensinlere ait olduğunu fark edebiliriz. Bitkilerde AFP'ler. Pleurocidin, insan patojenik mantar C. albicans'ın zarı ile etkileşimi için incelenen 25 kalıntılı bir peptittir . Bu peptidin plazma zarının bozulmasıyla C. albicans'a karşı fungisidal aktivite gösterdiği gösterilmiştir ( 70 ). Piscidin, model fosfolipid zarlarını geçirgen hale getirebilen, mantar önleyici aktivitesi nedeniyle araştırılan katyonik peptidin başka bir örneğidir ( 71).

      Mimetik moleküllerin tasarımı daha önce rapor edilmişti. Örneğin, Fullbeck ve diğerleri ( 59 ), villin başlığının C-terminalinde 35 kalıntılı alt alanın (H35) katlanmasını ışınlama yoluyla sunabilmek, ana zincirinin parçalarını değiştirmeden değiştirmek için SuperMimic yazılımını kullanmıştır. alt etki alanının genel yapısı. Peptitomimetik yapılar tasarlama çabalarımız, in silico analiz yoluyla dört bileşik bulmamıza yol açtı. Antifungal tahlil sonuçları, C2'nin seçilmiş mikroorganizmalar C. albicans ve S. cerevisiae ve A. niger'e karşı daha fazla antifungal aktiviteye sahip olduğunu göstermiştir.diğer bileşiklerden ziyade. Karşılaştığımız soru, bu bileşiğin antifungal aktivitesi için neden daha güçlü olduğu veya bu bileşiğin test edilen mikroorganizmaların lipid çift katmanlı membranı üzerinde etki edip etmediğiydi.

      Bu bileşiğin yapısına bakıldığında, bu yapının antifungal aktivitesini etkileyebilecek triptofandan oluştuğu anlaşılmıştır. Bu nedenle, triptofanın antifungal aktivite üzerindeki etkisini keşfetmek için bir literatür araştırması yapıldı. Triptofan genellikle peptitlerde veya proteinlerde bol miktarda amino asit kalıntısı değildir. Buradaki triptofan türevinin etkisi, peptitlerin zarlara bölünmesinin, kendisini zar/su arayüzüne yakın konumlandırma eğilimi tarafından dayatıldığı AMP'deki davranışına karşılık gelebilir. Triptofan açısından zengin olan antimikrobiyal peptitlerin örnekleri arasında tritriptisin (VRRPPWWWPFLRR) ve indolisidin (ILPWKWPWWPWRR-amid) bulunur ( 72 ). Indolicidin, triptofan kalıntıları açısından zengin olan güçlü antifungal ve antiviral aktiviteler sergiler.73 ). Lawyer ve meslektaşları ( 74 ), VRRFPWWWPFLRR dizisine sahip 13 amino asitlik triptofan açısından zengin bir bölgenin, geniş bir spektrumda güçlü antimikrobiyal aktiviteye sahip olduğunu buldu.

      Triptofan kalıntıları, membranı kapsayan proteinlerde de çok önemli bir rol oynar, lipid çift katmanlarının arayüzey bölgeleri için güçlü bir tercihe sahiptir. Ek olarak, triptofan kalıntıları, uygun katlanmalarını sağlamak için denatüre proteinlerde bile hem doğal hem de doğal olmayan hidrofobik temaslar oluşturarak protein katlanmasında yer alır. Triptofanın öneminin bir başka kanıtı, hekzapeptitlerden oluşan eksiksiz bir kombinasyon kitaplığının taranması üzerine, bu iki amino asitten (W ve R) zengin peptitlerin en yüksek antimikrobiyal aktivitelere sahip olduğunun bulunmasıdır ( 75 ).

      Ramamoorthy ve arkadaşları ( 76 ), hücre seçiciliği ile antimikrobiyal peptit granülizin olan G15'in membran etkileşimleri arasındaki korelasyonu araştırmış ve triptofan kalıntılarının ve muhtemelen hidrofobik yan zincirlerin fosfat baş grupları ile sıkı bir şekilde bağlanması için etkileşiminin rolünü keşfetmiştir. G15, lipid çift katmanlarına. Triptofan kalıntısının, zarın hidrofobik bölgesinin derinliklerinde değil, iki katmanlı arayüzde yer aldığını öne sürdüler. Andreu ve meslektaşları ( 31 ), sekropinler üzerinde yaptıkları çalışma sırasında, daha fazla triptofan içeren AMP'lerin mikroorganizmalara karşı aktif olduğunu öne sürdüler.

      Mimetik tasarımın, yeni tedavilerin geliştirilmesi ve ayrıca haşere kontrolü için biyokimyasal çalışmalarda birçok uygulaması vardır ( 78 , 79 ). Son zamanlarda, bazı halojenür ikameli indol dihidropirimidinler sentezlendi ve bunların mantar önleyici aktiviteleri rapor edildi ( 80 ). Singh ve meslektaşı ( 81 ), bazı bitki patojenik ve saprofitik mantarlara karşı antifungal aktivite gösteren venenatine adlı bir indol alkaloid Alstonia venenata izole etmişlerdir.

      Git: Çözüm


      Bu çalışmada, N-terminal bölgesinde ortak olacak genel bir model çıkarabilecek biyoinformatik araştırma yoluyla bir grup mantar önleyici peptit araştırdık. Daha fazla analizden sonra, sentezlenmek üzere KTC-Y peptidi seçildi. Ön çalışmalarımızda, söz konusu dekapeptidin sadece protoplast hücrelerinde aktif olduğu, bu tür molekül için derin hedef bölgesinin bir göstergesi ve hücre duvarının bu peptit için bir penetrasyon bariyeri rolü oynadığı gösterilmiştir. Hesaplamalı araçlar ve mimetiklere benzer mimetiklerin tasarımı ve tasarımı ile, mantar önleyici ilaç keşfi ve tasarım süreçlerinde aktif olan ve daha ileri çalışmalar için kullanılabilecek bir grup moleküle ulaşabildik. Hareket tarzlarını ve türevlerinin sentezini belirlemek için bu tür bileşikler üzerinde daha ileri deneyler şu anda grubumuzda uygulanmaktadır.

      Git: teşekkür


      Yazarlar, faydalı teknik yardımı için Bayan S. Enayati'ye teşekkür eder.

      Git: Referanslar

      1. Hong SY, Park TG, Lee KH. Yük artışının kısa bir antimikrobiyal peptidin özgüllüğü ve aktivitesi üzerindeki etkisi. Peptitler. 2001; 22 (10):1669-1674. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      2. Dhople V, Krukemeyer A, Ramamoorthy A. İnsan beta-defensin-3, çoklu biyolojik fonksiyonlara sahip bir antibakteriyel peptit. Biochim Biophys Acta. 2006; 1758 (9):1499-1512. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      3. Brogden KA. Antimikrobiyal peptitler: Bakterilerde gözenek oluşturucular veya metabolik inhibitörler. Nat Rev Mikrobiyol. 2005; 3 (3):238–250. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      4. Ouellet M, Otis F, Voyer N, Auger M. 14-mer ve 21-mer model amfipatik peptitler ve membranlar arasındaki etkileşimlerin biyofiziksel çalışmaları. Eylem biçimlerine ilişkin içgörüler. Biochim Biophys Acta. 2006; 1758 (9):1235–1244. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      5. Hancock RE. Katyonik peptitler: doğuştan gelen bağışıklıkta efektörler ve yeni antimikrobiyaller. Lancet Infect Dis. 2001; 1 (3):156-164. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      6. Amsterdam D. Sıvı ortamda antimikrobiyallerin duyarlılık testi. İçinde: Lorian V, editör. Laboratuvar tıbbında antibiyotikler. Baltimore Md: Williams ve Wilkins; 1996. s. 52–111. [ Google Akademik ]
      7. Lopez SF, Kim HS, Choi EC, Delgado M, Granja JR, Khasanov A, et al. Döngüsel D,L-alfa-peptid mimarisine dayalı antibakteriyel maddeler. Doğa. 2001; 412 (6845):452–455. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      8. Soltani S, Keymanesh K, Sardari S. Yapay sinir ağları ile membran etkili antifungal peptitlerin yapısal özelliklerinin değerlendirilmesi. J Biol Sci. 2008; 8 (5):834-845. [ Google Akademik ]
      9. Chu KT, Xia L, Ng TB. Pleurostrin, istiridye mantarından elde edilen bir mantar önleyici peptit. Peptitler. 2005; 26 (11):2098-2103. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      10. Wong JH, Ng TB. Vulgarinin, kuru fasulyeden (Phaseolus vulgaris) elde edilen geniş spektrumlu bir mantar önleyici peptit Int J Biochem Cell Biol. 2005; 37 (8):1626-1632. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      11. Ye XY, Ng TB, Rao PF. Cicerin ve arietin, farklı antifungal potansiyellere sahip yeni nohut peptitleri. Peptitler. 2002; 23 (5):817-822. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      12. Lin P, Xia L, Ng TB. Bir Brassica türünün tohumlarından bir antifungal lipid transfer peptidinin ilk izolasyonu. Peptitler. 2007; 28 (8):1514–1519. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      13. Fujimura M, Minami Y, Watanabe K, Tadera K. Karabuğday tohumlarından (Fagopyrum esculentum Moench) yeni tip antimikrobiyal peptitler Fa-AMP1 ve Fa-AMP2'nin saflaştırılması, karakterizasyonu ve dizilimi Biosci Biotechnol Biochem. 2003; 67 (8):1636-1642. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      14. Wong JH, Ng TB. Lunatusin, lima fasulyesinden (Phaseolus lunatus L.) elde edilen tripsin stabil bir antimikrobiyal peptit . 2005; 26 (11):2086–2092. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      15. Iijima R, Kisugi J, Yamazaki M. Deniz tavşanı Dolabella auricularia'dan yeni bir antimikrobiyal peptit. Dev Comp İmmünol. 2003; 27 (4):305–311. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      16. Ng TB. Mantarlardan elde edilen peptitler ve proteinler. Peptitler. 2004; 25 (6):1055–1073. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      17. Pelegrini PB, Noronha EF, Muniz MAR, Vasconcelos IM, Chiarello MD, Oliveira JT, et al. 2S albümin proteinlerine benzerlik gösteren çarkıfelek meyvesi (Passiflora edulis) tohumlarından elde edilen bir mantar önleyici peptit. Biochim Biophys Acta. 2006; 1764 (6):1141–1146. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      18. Thevissen K, Francois EJA, Sijtsma L, Amerongen A, Schaaper WMM, Meloen R, et al. Impatiens balsamina antimikrobiyal peptitler Ib-AMP1 ve Ib-AMP4'ten türetilen sentetik peptitlerin antifungal aktivitesi. Peptitler. 2005; 26 (7):1113–1119. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      19. Wong JH, Ng TB. Sesquin, tümör hücrelerine ve HIV-1 ters transkriptazına karşı inhibitör aktiviteleri olan, öğütülmüş fasulyeden elde edilen güçlü bir defensin benzeri antimikrobiyal peptit. Peptitler. 2005; 26 (7):1120–1126. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      20. Huang RH, Xiang Y, Liu XZ, Zhang Y, Hu Z, Wang DC. Eucommia ulmoides Oliv'in kabuğundan beş disülfid motifi ile ayrılan iki yeni mantar önleyici peptit. FEBS Lett. 2002; 521 (1-3):87-90. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      21. Wang HX, Ng TB. Siyah kabak çekirdeğinden arginin, glutamat ve glisin kalıntılarında bol miktarda bulunan yeni bir mantar önleyici peptit olan cucurmoschin izolasyonu. Peptitler. 2003; 24 (7):969-972. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      22. Wang X, Bunkers GJ, Walters MR, Thoma RS. Peynir yosunundan (Malva parviflora) üç antifungal proteinin saflaştırılması ve karakterizasyonu Biochem Biophys Res Commun. 2001; 282 (5):1224–1228. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      23. Ngai PHK, Ng TB. Coccinin, büyük kızıl fasulyelerden elde edilen antiproliferatif ve HIV-1 ters transkriptaz inhibitör aktivitelerine sahip bir antifungal peptit. Peptitler. 2004; 25 (12):2063–2068. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      24. Ngai PHK, Zheng Z, Ng TB. Agrocybin, yenilebilir mantar Agrocybe cylindracea'dan bir mantar önleyici peptit. Peptitler. 2005; 26 (2):191–196. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      25. Koo JC, Lee SY, Chun HJ, Cheong YH, Choi JS. Pharbitis nil L. tohumundan izole edilen iki hevein homologu, güçlü antifungal aktivite sergiler. Biochimica ve Biophysica Açta. 1998; 1382 (1):80–90. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      26. Wang HX, Ng TB. Kırmızı mercimek tohumlarından bir antifungal peptit. Peptitler. 2007; 28 (3):547-552. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      27. Wang HX, Ng TB, Liu Q. Alveolarin, yabani mantar Polyporus alveolaris'ten yeni bir antifungal polipeptid. Peptitler. 2004; 25 (4):693–696. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      28. Ngai PHK, Ng TB. Lentin, insan immün yetmezlik virüsü-1 ters transkriptaz aktivitesi ve lösemi hücrelerinin proliferasyonu üzerinde inhibitör etkileri olan shitake mantarından yeni ve güçlü bir antifungal protein. Hayat Bilimi. 2003; 73 (26):3363-3374. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      29. Lam SK, Ng TB. Bir mantardan (Lyophyllum shimeiji) bir ribozomu inaktive edici protein ve bir mantar önleyici proteinin ilk eşzamanlı izolasyonu ve bunların mantar önleyici etkisinin sinerjizmi için kanıt. Arch Biochem Biophys. 2001; 393 (2):271–280. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      30. Yang X, Li J, Wang X, Fang W, Bidochka MJ, She R, Xiao Y, et al. Psc-AFP, Psoralea corylifolia tohumlarından tripsin inhibitör aktivitesine sahip bir antifungal protein. Peptitler. 2006; 27 (7):1726–1731. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      31. Ye XY, Ng TB. Börülce 10-kDa protein öncüsüne sekans homolojisi olan barbunya ve kırmızı fasulyeden elde edilen peptitler, mantar önleyici, mitojenik ve HIV-1 ters transkriptaz inhibe edici aktiviteler sergiler. Biochem Biophys Res Komün. 2001; 285 (2):424–429. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      32. Wang H, Ng TB. Seylan ıspanak tohumlarından yeni mantar önleyici peptitler. Biochem Biophys Res Komün. 2001; 288 (4):765–770. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      33. Gao GH, Liu W, Dai JX, Wang JF, Hu Z, Zhang Y, et al. PAFP-S'nin çözelti yapısı: Phytolacca americana tohumlarından yeni bir knottin tipi antifungal peptit. Biyokimya. 2001; 40 (37):10973-10978. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      34. Skerlavaj B, Benincasa M, Risso A, Zanetti M, Gennaro R. SMAP-29: koyun lökositlerinden güçlü bir antibakteriyel ve antifungal peptit. FEBS Lett. 1999; 463 (1-2):58-62. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      35. Wang H, Ng TB. Kurutulmuş genç ağustos böceklerinden yeni ve güçlü bir antifungal peptit olan cicadin'in izolasyonu. Peptitler. 2002; 23 (1):7–11. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      36. Wang HX, Ng TB. Eryngin, yenilebilir mantar Pleurotus eryngii'nin meyve veren gövdelerinden yeni bir mantar önleyici peptit. Peptitler. 2004; 25 (1):1–5. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      37. Lampert A, Noble C, Davies W, Haefner B, Wilson J. Monitor-biology. Bugün İlaç Teşhisi. 2004; 9 (22):985-987. [ Google Akademik ]
      38. Yang WY, Wen SY, Huang YD, Ye MQ, Deng XJ, Han D, et al. Drosophila melanogaster'da altı antifungal peptit Drosomycin izoformunun fonksiyonel farklılığı. Gen. 2006; 379 :26–32. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      39. Yamagishi H, Fitzgerald DH, Sein T, Walsh TJ, O'Connell BC. Tükürük, eksojen olarak eklenen histatin 3'ün Candida albicans'a karşı antifungal aktivitesini etkiler. FEMS Mikrobiyol Lett. 2005; 244 (1):207–212. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      40. Huang X, Xie W, Gong Z. Ginkgo biloba'dan bir kitin bağlayıcı proteinin özellikleri ve mantar önleyici aktivitesi. FEBS Lett. 2000; 478 (1):123–126. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      41. Ahn HS, Cho W, Kang SH, Ko SS, Park MS, Cho H, et al. Bir böcek defensin proteini olan Tenecin 1'in alfa sarmal alanı temelinde yeni antimikrobiyal peptitlerin tasarımı ve sentezi ve yapı-aktivite ilişkisi çalışması. Peptitler. 2006; 27 (4):640–648. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      42. Simmaco M, Mignogna G, Barra D, Bossa F. Rana esculenta'nın cilt salgılarından antimikrobiyal peptitler. J Biol Chem. 1994; 269 ​​(16)::11956–11961. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      43. De Grado WF, Kezdy FJ, Kaiser ET. Melittin benzeri aktiviteye sahip sitotoksik bir peptidin tasarımı, sentezi ve karakterizasyonu. J Am Chem Soc. 1981; 103 :679–681. [ Google Akademik ]
      44. Oh JE, Hong SY, Lee KH. Membran aktif antifungal peptit ve psödopeptitleri arasındaki özelliklerin karşılaştırılması. Bioorg Med Chem. 1999; 7 (11):2509–2515. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      45. Tanaka H, ​​Suzuki K. Yaprak böceği Gastrophysa atrocyanea'nın diyapoza özgü bir peptidinin (DSP) ekspresyon profili ve çift iplikli RNA ile DSP'nin susturulması. J Böcek Fizyol. 2005; 51 (6):701–707. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      46. ​​Wong JH, Ng TB. Gymnin, Yunnan fasulyesi (Gymnocladus chinensis Baill) Peptitlerinden elde edilen güçlü bir defensin benzeri mantar önleyici peptit . 2003; 24 (7):963-968. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      47. Jang WS, Kim HK, Lee KY, Kim SA, Han YS, Lee IH. Halosidin'den türetilen sentetik peptitin mantar önleyici aktivitesi, tunikten antimikrobiyal peptit, Halocynthia aurantium. FEBS Lett. 2006; 580 :1490–1496. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      48. Wang HX, Ng TB. Ascalin, arpacık soğanlarından insan immün yetmezlik virüsü tip 1 ters transkriptaz inhibe edici aktiviteye sahip yeni bir mantar önleyici peptit. Peptitler. 2002; 23 (6):1025–1029. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      49. Wang HX, Ng TB. Bezelye Pisum sativum var'dan bir antifungal protein. arvense Poir. Peptitler. 2006; 27 (7):1732–1737. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      50. Chu KT, Liu KH, Ng TB. Cicerarin, yeşil nohuttan yeni bir mantar önleyici peptit. Peptitler. 2003; 24 (5):659-663. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      51. Lipkin A, Anisimova V, Nikonorova A, Babakov A, Krause E, Bienert M, et al. Amaranth (Amaranthus retroflexus L.) tohumlarından bir antimikrobiyal peptit Ar-AMP. Fitokimya. 2005; 66 (20):2426–2431. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      52. Xia L, Ng TB. Actinchinin, altın kivi meyvesinden yeni bir mantar önleyici protein. Peptitler. 2004; 25 (7):1093–1098. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      53. Cambridge (Birleşik Krallık): Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü; c1980. EBI: Çoklu dizi hizalaması [İnternet] [Kasım 6'dan alıntılanmıştır] http://www.ebi.ac.uk/ adresinden erişilebilir . [ Google Akademik ]
      54. Notredame C, Higgins DG, Heringa J. T-Coffee: Hızlı ve doğru çoklu dizi hizalaması için yeni bir yöntem. J Mol Biol. 2000; 302 (1):205–217. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      55. Cambridge (Birleşik Krallık): Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü; c1980. EBI: Temel Yerel Hizalama Arama Aracı [İnternet] [Kasım 2012'de alıntılanmıştır] Şuradan erişilebilir: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi/ . [ Google Akademik ]
      56. San Diego (CA): San Diego Süper Bilgisayar Merkezi (SDSC); 2003. PDB: Protein Veri Bankası [İnternet] (6 Kasım 2012'de alıntılanmıştır). http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do/ adresinden ulaşılabilir . [ Google Akademik ]
      57. Goede A, Michalsky E, Schmidt U, Preissner R. Protein yapılarına süper mimik-uyumlu peptit mimetikleri. BMC Biyoinformatik. 2006; 7:11 . [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      58. Fullbeck M, Michalsky E, Jaeger IS, Henklein P, Kuhn H, Ruck-Braun K, et al. Foto-değiştirilebilir inhibitörlerin tasarımı ve biyolojik değerlendirmesi. Genom Bilgisi. 2006; 17 (1):141–151. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      59. Romano J, Nimrod G, Ben-Tal N, Shadkchan Y, Baruch K, Sharon H, et al. Aspergillus fumigatus ECM33 homologunun bozulması, hızlı konidyal çimlenme, antifungal direnç ve hipervirülans ile sonuçlanır. Mikrobiyoloji. 2006; 152 (7):1919–1928. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      60. Cuenca-Estrella M, Lee-Yang W, Ciblak MA, Arthington-Skaggs BA, Mellado E, Warnock DW, et al. Candida türlerinin antifungal duyarlılık testi için NCCLS M27-A ve EUCAST broth mikrodilüsyon prosedürlerinin karşılaştırmalı değerlendirmesi. Antimikrobiyal Ajanlar Chemother. 2002; 46 (11):3644–3647. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      61. Gomez-Lopez A, Aberkane A, Petrikkou E, Mellado E, Rodriguez-Tudela JL, Cuenca-Estrella M. Aspergillus spp. J Clin Mikrobiyol. 2005; 43 (3):1251–1255. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      62. Bern (İsviçre): SIB İsviçre Biyoinformatik Enstitüsü; 1995-2001. Swiss-Pdb Viewer [İnternet] (6 Kasım 2012'de alıntılanmıştır). Şu adresten edinilebilir: http://www.expasy.ch/spdbv,v3.7SP5/ [ Google Akademik ]
      63. Nürnberg, Almanya: Frederick Ulusal Kanser Araştırma Laboratuvarı (FNLCR); c1997. Gelişmiş NCI Veritabanı Tarayıcısı [İnternet] (6 Kasım 2012'de alıntılanmıştır) Şuradan erişilebilir: http://cactus.nci.nih.gov/ncidb2 . [ Google Akademik ]
      64. ZINC [İnternet] San Francisco (CA): California San Francisco Üniversitesi'ndeki (UCSF) Shoichet Laboratuvarı; 2004. (akt. 2012 6 Kasım). Şu adresten edinilebilir: http://zinc.docking.org/ [ Google Akademik ]
      65. Ruge E, Korting HC, Borelli C. Antifungal hedeflerin üç boyutlu karakterizasyonunun mevcut durumu ve ilaç tasarımında moleküler modelleme için kullanımı. Int J Antimicrob Ajanlar. 2005; 26 (6):427–441. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      66. Stigers KD, Soth MJ, Nowic JS. Protein ikincil yapılarını taklit etmek için katlanan tasarlanmış moleküller. Curr Opin Chem Biol. 1999; 3 (6):714–723. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      67. Edgar RC. KAS: azaltılmış zaman ve mekan karmaşıklığına sahip çoklu dizi hizalama yöntemi. BMC Biyoinformatik. 2004; 5 (1):113. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      68. Rosenberg MS. Çoklu dizi hizalama doğruluğu ve evrimsel mesafe tahmini. BMC Biyoinformatik. 2005; 6 (1):278. [ PMC ücretsiz makale ] [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      69. Thomma B, Cammue BPA, Thevissen K. Bitki defensinleri. Bitki. 2002; 216 (2):193–202. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      70. Jung HJ, Park YK, Sung WS, Suh BK, Lee J, Hahm KS, et al. Pleurosidinin membran aktif mekanizma ile mantar öldürücü etkisi ve proteolitik direnç için enantiyomerik analog tasarımı. Biochim Biophys Acta. 2007; 1768 (6):1400–1405. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      71. Sung WS, Lee J, Lee DG. Pisidin'in Candida albicans üzerindeki mantar öldürücü etkisi: lipid veziküllerinde gözenek oluşumu ve mantar zarlarında aktivite. Biol Ecz Boğa. 2008; 31 (10): 1906–1910. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      72. Epand RM, Vogel HG. Antimikrobiyal peptitlerin çeşitliliği ve etki mekanizmaları. Biochim Biophys Acta. 1999; 1462 :11–28. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      73. Saberwal G, Nagaraj R. Zarların bariyer fonksiyonunu bozarak etki eden hücreli-litik ve antibakteriyel peptitler: konformasyonel özelliklerinin yönleri, yapı-fonksiyon korelasyonları ve membranı rahatsız etme yetenekleri. Biochim Biophys Acta. 1994; 1197 (2):109-131. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      74. Avukat C, Pai S, Watabe M, Borgia P, Mashimo T, Eagleton L, et al. Yeni bir antibakteriyel peptit ailesinin varsayılan bir domuz öncü proteininden türetilen 13 amino asit triptofan bakımından zengin bir peptidin antimikrobiyal aktivitesi. FEBS Lett. 1996; 390 (1):95–98. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      75. Chan DI, Prenner EJ, Vogel HJ. Triptofan ve arginin açısından zengin antimikrobiyal peptitler: Yapıları ve etki mekanizmaları. Biochim Biophys Acta. 2006; 1758 (9):1184–1202. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      76. Ramamoorthy A, Thennarasu S, Tan A, Lee DK, Clayberger C, Krensky AM. Hücre seçiciliği, zara özgü etkileşimlerle ilişkilidir: Granülizinden türetilen antimikrobiyal peptit G15 üzerine bir vaka çalışması. Biochim Biophys Acta. 2006; 1758 :154-163. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      77. Andreu D, Merrifield RB, Steiner H, Boman HG. Sekropin A'nın N-terminal analogları: sentez, antibakteriyel aktivite ve konformasyonel özellikler. Biyokimya. 1985; 24 (7):1683–1688. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      78. Xie Y, Kai ZP, Tobe SS, Deng XL, Ling Y, Wu XQ, et al. Böcek allatostatinlerinin peptidomimetik analoglarının tasarımı, sentezi ve biyolojik aktivitesi. Peptitler. 2011; 32 (3):581–586. [ PubMed ] [ Google Akademik ]
      79. Deshmukh R, Purohit HJ. Peptit yapı iskeleleri: çeşitli terapötik potansiyellere sahip esnek moleküler yapılar. Int J Pept Res Ther. 2012; 18 (2):125–143. [ Google Akademik ]
      80. Heda LC, Sharma R, Pareek C, Chaudhari PB. 5-ikameli indol dihidropirimidinlerin bazı türevlerinin sentezi ve antimikrobiyal aktivitesi. EJ Chem. 2009; 6 (3):770–774. [ Google Akademik ]
      81. Singh UP, Sarma BK, Mishra PK, Ray AB. Alstonia venenata'dan izole edilen bir indol alkaloidi olan venenatinin antifungal aktivitesi. Folia Mikrobiol (Praha) 2000; 45 (2):173–176. [ PubMed ] [ Google Akademik ]

      Yorum yap

      Hazırlanıyor...
      X